在 Qt4 上安装 MayaVi 导致分段错误

Question

我正在尝试在我的计算机上安装 MayaVi。我使用的是配备 OS X 10.6.8、4 GB RAM 的 MacBook Air。

我的 python 和大部分堆栈都是通过 Homebrew 或 pip 构建的。特别是对于 python2.7、ipython、Qt4、numpy、scipy、vtk 等来说更是如此。VTK 在 Homebrew 中使用 --python 和 --qt-extern 标志安装，并且所有构建都很好。我没有安装 wxPython，因为我无法通过 pip、手动构建或二进制文件让它工作。

如果我运行 ipython -q4thread，我无法成功执行 from mayavi import mlab，因为我收到与使用 PyQt 的两个不同 API 相关的错误：http://groups.google.com/group/spyderlib/browse_thread/thread/36a35baec74ca144

但是，如果我单独运行 ipython ，我可以成功运行 从 Mayavi 导入 mlab。然后我尝试遵循以下示例： http://github.enthought.com/mayavi/mayavi /example_using_with_scipy.html，其中包括以下命令：

import numpy as np

def V(x, y, z):
    """ A 3D sinusoidal lattice with a parabolic confinement. """
    return np.cos(10*x) + np.cos(10*y) + np.cos(10*z) + 2*(x**2 + y**2 + z**2)

X, Y, Z = np.mgrid[-2:2:100j, -2:2:100j, -2:2:100j]

from mayavi import mlab
mlab.contour3d(X, Y, Z, V)

这一切都正常，我会弹出一个窗口，我可以旋转 3d 绘图等。但是，然后我单击该图标打开管道，这会打开另一个窗口。然后教程说双击“等值面”来更改其属性。一旦我这样做，我就会得到一个可重现的分段错误。

我不知道如何开始找出问题所在。

或者，我可以从命令行运行 MayaVi：mayavi2，然后会弹出 GUI。当我这样做时，我得到以下输出：

Warning: Unable to import the wx backend for pyface due to traceback: Traceback (most recent call last):
      File "/usr/local/Cellar/python/2.7.1/lib/python2.7/site-packages/pyface/toolkit.py", line 45, in _init_toolkit
        be = import_toolkit(tk)
      File "/usr/local/Cellar/python/2.7.1/lib/python2.7/site-packages/pyface/toolkit.py", line 31, in import_toolkit
        __import__(be + 'init')
      File "/usr/local/Cellar/python/2.7.1/lib/python2.7/site-packages/pyface/ui/wx/init.py", line 14, in <module>
        import wx
    ImportError: No module named wx

尽管确实弹出了 GUI，但如果我尝试执行任何操作，则会出现段错误。

如果您对解决此问题有任何想法，或者对成功重新安装软件包有任何指导，请告诉我。

谢谢！

乌里

Answer 1

我还有一台运行 OS X 10.7.4 (Lion) 的 MacBook Air。二月份我花了很多时间让 Mayavi 工作，最终成功地达到了可以制作科学绘图的程度。这仍然意味着一些示例和测试无法正确运行，并且 GUI 在控制台中生成了大量错误消息，但没有崩溃（大多数情况下）。现在，我设法破坏了我的 Python 安装（可能是通过升级 numpy），所以我需要重新安装。唉，六个月后事情并没有变得更容易！

仍然没有可行的预编译选项。我从这里尝试了 Enthought Python 发行版： http://www.enthought.com/repo/.epd_academic_installers< /a>. Mac 上的 ETS 仍然没有 64 位版本，组件很古老，基于 wxPython 的 Mayavi 看起来很丑，感觉很慢而且反应迟钝。回到 brew 和 pip。经过大量的试验和错误，以下是或多或少有效的方法：

1. 先决条件

隐藏/卸载损坏的 Homebrew Python 安装：

mv /usr/local/lib/python2.7/site-packages /usr/local/lib/python2.7/site-packages-old 
mv /usr/local/share/python /usr/local/share/python-old
brew uninstall python pyqt pyside vtk

从 Xcode (4.4.1) 中，选择 llvm-gcc 作为编译器（我用 clang 不太成功）：

cd /usr/bin
sudo rm cc c++
sudo ln -s gcc cc
sudo ln -s g++ c++

2. 安装

2.1 Python

brew install python --framework --universal

指向新安装：

cd /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions
rm Current
ln -s /usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/Current .

如果安装了 EPD，则需要在/Library/Frameworks/Python.framework/Versions，否则 EPD 将优先。

2.2 Numpy

从源代码安装 numpy （pip 1.2 目前无法正确安装 npymath.ini，这将导致 scipy 无法构建）：

git clone https://github.com/numpy/numpy.git
cd numpy
git checkout v1.6.2
python setup.py install

由于有如此多的包链接到 numpy，我强烈建议您查看今天发布的正式版本 1.6.2。接下来使 numpy 标头可见：

cd /usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/include/python2.7
ln -s /usr/local/lib/python2.7/site-packages/numpy/core/include/numpy .

2.3 qt、pyqt、vtk

安装 qt (4.8.2) 和 pyqt (4.9.4)：

brew install qt
brew install pyqt

也可以安装 pyside (1.1.1)，

brew install pyside

但这似乎会产生更多崩溃 与 Mayavi。无论如何，请附加

export QT_API=pyqt

到 .bashrc 以避免任何混淆。接下来安装 vtk（5.10.0；5.8.0 也可以）

brew install vtk --python --tcl --examples --qt

...然后等待（编译大约需要 40 分钟）。 --qt 标志并不是绝对必要的，但也没有什么坏处。

接下来，从 http://www.vtk 下载 vtk 数据.org/files/release/5.10/vtkdata-5.10.0.tar.gz，在某处解压并获得 VTK_DATA_ROOT 环境变量指向VTKData目录。 启动 TCL 示例中的一些示例

/usr/local/share/vtk/Examples

使用 python .py 启动 python 示例和使用 vtk 。工作起来绝对漂亮，对吧？那么接下来让我们看看 Mayavi 如何把这一切搞砸了...

2.4 ETS 和 Mayavi

虽然

pip install mayavi

可以让您有所收获，但它似乎比从 github 安装前沿技术会产生更多的崩溃。获取 https://github.com/enthought/ets/raw/master/ets。 py 并运行

python ets.py clone

以克隆 ETS git 存储库。您只需要 apptools、mayavi、pyface、traits 和 traitsui，可能 < code>envisage 如果您想从命令行运行 mayavi2。因此，删除其他目录并执行

python ets.py develop

此操作应该允许您通过运行 mayavi/examples/tvtk 和 mayavi/examples/mayavi 来运行存储库中的一些示例>python .py 并使用 GUI 进行操作。有很多控制台错误和很多 GUI 功能不起作用，例如选择 LUT 表。但希望它不会崩溃。

2.5 scipy、matplotlib、ipython

我更喜欢从 github 获取 scipy 和 matplotlib 的最新技术。首先使用 brew 安装所有依赖项。然后

git clone https://github.com/scipy/scipy.git
cd scipy
python setup.py install

git clone https://github.com/matplotlib/matplotlib.git
cd matplotlib
python setup.py install

使用pip安装ipython (0.13)。首先安装 qtconsole：

pip install pygments
pip install pyzmq

然后

pip install ipython

有几种可能的方法来启动 ipython 与 mayavi 一起使用，具体取决于谁控制 QT 事件循环：

• ipython without mlab.show()：挂起。
• ipython 与 mlab.show()：可以工作，但提示可能会变得无响应。
• ipython --gui=qt 或 ipython --pylab=qt：可以工作，但“保存”对话框会立即关闭。
• 没有 mlab.show() 的 ipython qtconsole：挂起。
• ipython qtconsole 与 mlab.show()：有效。
• ipython qtconsole --gui=qt 或 ipython qtconsole --pylab=qt：有效。

祝你好运！