我可以使用 BLAST 比较 2 个非生物字符串吗?
我知道 BLAST(基本局部对齐搜索工具)的设计目的。但我对使用这种高级文本比较及其最终效果感兴趣。
I know what BLAST (The Basic Local Alignment Search Tool) was designed for. But I am interested in using such advanced text comparison and its final effects.
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评论(1)
您可以使用 vmatch。
如果您想使用子字符串的局部对齐工具,您可能需要使用 STELLAR,论文:http://www.biomedcentral.com/1471-2105/12/S9/S15/
它可以完成blast所做的一切,但有相当方便的使用选项字符。
You could use vmatch.
If you want to use a tool for local alignment of subtrings, you might want to use STELLAR though, paper: http://www.biomedcentral.com/1471-2105/12/S9/S15/
It does everything blast does, but has quite convenient option to use chars.