如何使用 C# 将普通 jpeg 图像字节转换为 DICOM 本机图像字节

Question

目前我正在编写一个用于将 JPEG 转换为 DICOM 图像 的模块。经过分析，我已经完成了标签渲染，现在图像在 DICOM 文件中未正确渲染。

是否有任何算法可以将JPEG转换为DICOM。

Answer 1

继续Matthieu的回应，这里有一个非常简单的方法，使用优秀的GDCM库和他引用的示例为JPEG流创建DICOM信封（注意我使用了一些辅助类，但非常简单）：

       ImageReader r = new ImageReader();
        gdcm.Image image = r.GetImage();
        image.SetNumberOfDimensions(2);
        DataElement pixeldata = DataElementHelper.PixelData;
        string file1 = @"D:\testfil.jpeg";

        System.IO.FileStream infile =
            new System.IO.FileStream(file1, System.IO.FileMode.Open, System.IO.FileAccess.Read);
        //uint fsize = gdcm.PosixEmulation.FileSize(file1);

        //byte[] jstream = new byte[fsize];
        //infile.Read(jstream, 0, jstream.Length);

        byte[] jstream = System.IO.File.ReadAllBytes(file1);
        uint fsize = (uint) jstream.Length;

        SmartPtrFrag sq = SequenceOfFragments.New();
        Fragment frag = new Fragment();
        frag.SetByteValue(jstream, new gdcm.VL((uint)jstream.Length));
        sq.AddFragment(frag);
        pixeldata.SetValue(sq.__ref__());

        // insert:
        image.SetDataElement(pixeldata);


        PhotometricInterpretation pi = new PhotometricInterpretation(PhotometricInterpretation.PIType.MONOCHROME2);
        image.SetPhotometricInterpretation(pi);

        // FIXME hardcoded:
        PixelFormat pixeltype = new PixelFormat(PixelFormat.ScalarType.UINT8);
        image.SetPixelFormat(pixeltype);

        TransferSyntax ts = new TransferSyntax(TransferSyntax.TSType.JPEGBaselineProcess1);
        image.SetTransferSyntax(ts);

        image.SetDimension(0, (uint)1700);
        image.SetDimension(1, (uint)2200);

        ImageWriter writer = new ImageWriter();
        gdcm.File file = writer.GetFile();


        var ds = file.GetDataSet();
        DataElement patientID = DataElementHelper.PatientID;
        DataElement patientName = DataElementHelper.PatientName;
        DataElement accessionNumber = DataElementHelper.AccessionNumber;
        DataElement studyDate = DataElementHelper.StudyDate;
        DataElement studyTime = DataElementHelper.StudyTime;
        DataElement studyInstanceUID = DataElementHelper.StudyInstanceUID;
        DataElement seriesInstanceUID = DataElementHelper.SeriesInstanceUID;
        DataElement mediaStorage = DataElementHelper.SOPClassUID;

        string studyUID = new gdcm.UIDGenerator().Generate();
        string seriesUID = new gdcm.UIDGenerator().Generate();

        //pixelData.SetArray(b, (uint)b.Length);
        DataElementHelper.SetDataElement(ref patientName, "TEST^MARCUS");
        DataElementHelper.SetDataElement(ref patientID, "0000000801");
        DataElementHelper.SetDataElement(ref accessionNumber, "0000000801-12345");
        DataElementHelper.SetDataElement(ref studyDate, DateTime.Now.ToString("yyyyMMdd"));
        DataElementHelper.SetDataElement(ref studyTime, DateTime.Now.ToString("HHmmss"));
        DataElementHelper.SetDataElement(ref studyInstanceUID, studyUID);
        DataElementHelper.SetDataElement(ref seriesInstanceUID, seriesUID);
        DataElementHelper.SetDataElement(ref mediaStorage, "1.2.840.10008.5.1.4.1.1.7");
        ds.Insert(patientID);
        ds.Insert(patientName);
        ds.Insert(accessionNumber);
        ds.Insert(studyDate);
        ds.Insert(studyTime);
        ds.Insert(studyInstanceUID);
        ds.Insert(seriesInstanceUID);
        ds.Insert(mediaStorage);

        writer.SetImage(image);
        writer.SetFileName("gdcm_test.dcm");
        bool ret = writer.Write();

Answer 2

请查看 mdcm C# DICOM 库，最初由 Colby Dillion 编写。他开发了通往 IJG/LibJPEG 和 OpenJPEG 代码库，因此 mdcm 提供 8/12/16 位有损和无损 JPEG 支持以及 JPEG-2000 支持。

Colby 的原始库具有 WinForms 依赖项。我在此处创建了一个针对 Silverlight 和 WPF 的 mdcm 分支。该库的 WPF 版本可以充分利用 Colby 最初实现的相同 JPEG(-2000) 编解码器。
另一方面，Silverlight 版本目前无法从这些编解码器中受益。我已尝试应用 FJCore 和 LibJpeg.Net 库，用于在 Silverlight 中支持有损 JPEG，但这些库目前仅支持 8 位图像。

问候，
安德斯@Cureos

Answer 3

.NET 本身没有支持 DICOM 的功能。您将需要使用图书馆。我不知道有什么免费的，但我使用过 LeadTools，它可以做到这一点（需要付费）。但我只会给它 4/10，并且我会重新开始你寻找其他选择。

Answer 4

您不需要将 JPEG“转换”为 DICOM。 DICOM 只是 JPEG 流的“信封”。以下是我在 GDCM 中封装（=放入 DICOM 信封）现有 MPEG2 文件的方法：

http://gdcm.sourceforge.net/html/MpegVideoInfo_8cs-example.html

只需针对输入 JPEG 文件调整该代码即可。例如，看看：

http://gdcm.sourceforge.net/html/DecompressJPEGFile_8cs- example.html

不需要解压/重新压缩，那样会浪费资源。