R 或 python 中的隐马尔可夫模型实现
您知道有关如何在 python、R (Bioconductor) 中实现 HMM 的优秀文献和/或教程吗？ （尤其是序列分析）
Do you know any good literature and/or tutorials about how to implement HMM in python, R (Bioconductor)? (especially for sequence analysis)
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评论（2）
CRAN 上有 HMM 包，这可能是一个很好的起点。
http://cran.at.r-project.org/web/packages/HMM/ index.html
这很容易从 R 本身找到：
There is the HMM package on CRAN, which might be a good place to start.
http://cran.at.r-project.org/web/packages/HMM/index.html
This is easily found from R itself:
GHMM for python 有一个教程，但它很短，而且他们承认“目前，GHMM 完全缺乏文档。"
我喜欢 拉宾纳论文。
我有一份关于使用 HMM 进行遗传图谱的技术报告。
我建议阅读一些拉宾纳的著作，然后实施一些东西。前向/后向方程只有几行。
GHMM for python has a tutorial, but it's short and they admit that "Currently, the GHMM is utterly lacking in documentation."
I like the Rabiner paper.
I have a technical report on the use of HMM for genetic mapping.
I recommend reading a bit of Rabiner and then implementing something. The forward/backward equations are just a few lines.