如何确保在 Ubuntu 中安装兼容版本的 JAGS 和 rjags？
我想编写一个脚本，在新的 ubuntu 安装上安装 JAGS 和 rjags，并且该脚本将独立于这些软件包的当前可用版本运行。我想知道如何做到这一点，同时避免版本之间的冲突。
我有以下 R 脚本，initialize.R：
system('apt-get install jags')
install.packages('rjags')
这样我就可以从 bash 运行：
sudo R --vanilla < initialize.R
但是，Ubuntu 存储库中 JAGS 的最新版本是 2.2，并且 CRAN 提供的 rjags 取决于 JAGS > 3.0。
我有兴趣安装兼容的 JAGS 和 rjags，也许是：
- 安装特定版本的 JAGS（例如 2.2）和兼容的 rjags 版本（哪个版本？
- ）当前在 ubuntu 存储库中的 JAGS 版本和适当的 rjags 版本，或者
- 通常在 cran 处安装最新版本的 rjags 和适当的 JAGS 版本
执行情况 1 的能力是很重要，但我也很好奇如何实现案例 2 和/或 3。
问题
- 我该如何做到这一点？
- 有没有更稳妥的方法？
更新：按照德克回答中的链接，以下内容有效：
add-apt-repository ppa:marutter/rrutter
apt-get update
apt-get install r-cran-rjags
I would like to write a script that installs JAGS and rjags on a new ubuntu installation, and that will work independently of the currently available versions of these packages. I'd like to know how I can do this while avoiding conflicts between versions.
I have the following R script, initialize.R:
system('apt-get install jags')
install.packages('rjags')
So that I can run from bash:
sudo R --vanilla < initialize.R
However, the most recent version of JAGS in the Ubuntu repository is 2.2, and the version of rjags available from CRAN depends on JAGS > 3.0.
I am interested in installing compatable JAGS and rjags, perhaps either:
- installing a specific version of JAGS (e.g. 2.2) and the compatable rjags version (which version?)
- generically installing the version of JAGS currently in the ubuntu repository and the appropriate rjags version, or
- generically installing the most recent version of rjags at cran and the appropriate version of JAGS
The ability to do case 1 is essential, but am also curious how I could implement cases 2 and/or 3.
questions:
- How can I do this?
- Is there a more sound approach?
update: following link in Dirk's answer, the following worked:
add-apt-repository ppa:marutter/rrutter
apt-get update
apt-get install r-cran-rjags
如果你对这篇内容有疑问，欢迎到本站社区发帖提问 参与讨论，获取更多帮助，或者扫码二维码加入 Web 技术交流群。
绑定邮箱获取回复消息
由于您还没有绑定你的真实邮箱，如果其他用户或者作者回复了您的评论，将不能在第一时间通知您！
发布评论
评论（1）
Michael Rutter 通过他的存储库提供了一个 r-cran-rjags 包；这适用于您已经安装的 jag 软件包。请参阅r-sig-devel 上的此消息有关详细信息，您可能需要订阅并关注 r-sig-debian 列表以随时了解这些内容。
Michael Rutter provides an
r-cran-rjagspackage via his repository; this works with the jags package you already have installed. See this message on r-sig-devel for details, and you may want to subscribe to and follow the r-sig-debian list to stay abreast of these things.