从 jar 加载文件时出现问题（类路径问题）

Question

当我尝试执行这段代码时： 包 uk.org.infectogenomics.agent；

import uk.org.infectogenomics.Agent.qa.Quasr;

public static void main(String[] args) {
//ommited some code
Runnable step = new Quasr(wf.getStepByPos(1));
}

我得到：

Exception in thread "main" java.lang.NoClassDefFoundError: uk/org/infectogenomic
s/Agent/qa/Quasr
at uk.org.infectogenomics.agent.Agent.main(Agent.java:55)
Caused by: java.lang.ClassNotFoundException: uk.org.infectogenomics.Agent.qa.Quasr
    at java.net.URLClassLoader$1.run(Unknown Source)
    at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method)
    at java.net.URLClassLoader.findClass(Unknown Source)
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(Unknown Source)
    at sun.misc.Launcher$AppClassLoader.loadClass(Unknown Source)
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(Unknown Source)
    ... 1 more

这是我的清单文件：

Manifest-Version: 1.0
Ant-Version: Apache Ant 1.8.2
Created-By: 1.6.0_25-b06 (Sun Microsystems Inc.)
Class-Path: lib/mysql-connector-java-5.1.17-bin.jar lib/aws-java-sdk-1.2.6.jar
X-COMMENT: Main-Class will be added automatically by build
Main-Class: uk.org.infectogenomics.agent.Agent

这是 jar 文件本身的列表：

META-INF/
META-INF/MANIFEST.MF
uk/
uk/org/
uk/org/infectogenomics/
uk/org/infectogenomics/agent/
uk/org/infectogenomics/agent/Assembly/
uk/org/infectogenomics/agent/hostEl/
uk/org/infectogenomics/agent/qa/
uk/org/infectogenomics/agent/taxonomy/
uk/org/infectogenomics/agent/Agent.class
uk/org/infectogenomics/agent/Assembly/Newbler.class
uk/org/infectogenomics/agent/Assembly/Velvet.class
uk/org/infectogenomics/agent/DBAccessor.class
uk/org/infectogenomics/agent/DateUtils.class
uk/org/infectogenomics/agent/Status$1.class
uk/org/infectogenomics/agent/Status$2.class
uk/org/infectogenomics/agent/Status$3.class
uk/org/infectogenomics/agent/Status$4.class
uk/org/infectogenomics/agent/Status.class
uk/org/infectogenomics/agent/Workflow.class
uk/org/infectogenomics/agent/WorkflowStep.class
uk/org/infectogenomics/agent/agent.properties
uk/org/infectogenomics/agent/hostEl/Fastq2FQone.class
uk/org/infectogenomics/agent/hostEl/RepeatMasker.class
uk/org/infectogenomics/agent/hostEl/SplitFiles.class
uk/org/infectogenomics/agent/qa/Quasr.class
uk/org/infectogenomics/agent/taxonomy/Phymbl.class

那么类路径应该是什么，因为我使用的是 Netbeans，所以我认为这是 IDE 的工作来实际处理这个问题。仅当我将所有内容打包到 jar 中时才会发生这种情况，当我从 IDE 运行代码时，一切都会按预期工作。

Answer 1

看看它找不到的类名：

uk/org/infectogenomics/Agent/qa/Quasr

现在看看你的 jar 文件内容：

uk/org/infectogenomics/agent/qa/Quasr.class

大小写有区别。我的猜测是，在某个时刻，您已经将包名称从小写切换了（在我看来，应该是这样），但您使用的是 Windows（大小写为不敏感的文件系统），因此现有的“代理”目录被保留，而不是被擦除并替换为“代理”。

如果你从头开始重建，很可能会解决所有问题。另一方面，我建议更改包名称以遵循正常的 Java 命名约定。