在 R 中，我可以使用工作区保存加载的包吗？

Question

R 通常只将对象保存在 .GlobalEnv 中：

$ R
> library(rjson)
> fromJSON
function (...) ...
> q(save='yes')
$ R
> fromJSON
Error: object 'fromJSON' not found

有没有办法也保存此信息？

Answer 1

现在，您可以将 R 会话信息保存到文件中并将其加载到另一个会话中。

首先安装“session”包：

install.packages('session')

加载您的库和数据，然后将会话状态保存到文件中：

library(session)
library(ggplot2) # plotting

test <- 100

save.session(file='test.Rda')

然后您可以在另一个会话中加载会话状态：

library(session)

restore.session(file='test.Rda')

#ggplot2 (and associated data) should have loaded with the session data
head(diamonds)
ggplot(data = diamonds, aes(x = carat)) +
  geom_histogram()

print(test)

参考：https://www.rdocumentation.org/packages/session/versions/1.0.3/topics/save.session

Answer 2

据我所知，没有。工作区用于数据和函数等对象。启动 R 并加载特定的包就是 .Rprofile 文件的用途，并且每个目录中可以有不同的文件。

我想，您可以在工作区中保存一个函数来加载所需的包，然后在第一次启动 R 时运行该函数。

Answer 3

joran 是对的，但我想提一下一种技术，虽然很麻烦，但可能会有所帮助。

您可以使用检查点程序（例如 DMTCP）来保存整个 R 进程并稍后重新启动。

Answer 4

我建议不要在 r 会话之间保存任何内容，而是使用代码重新创建它。这更有可能导致可重复的结果。