geom_smooth() 有哪些可用方法?

发布于 2024-11-28 12:57:37 字数 748 浏览 3 评论 0原文

我正在使用 ggplot2 中的 geom_smooth() 。

Hadley Wickham 的书(“ggplot2 - Elegant Graphics for Data Analysis”)中有一个示例(第 51 页),其中使用了 method="lm"。在在线手册中没有讨论method参数。我看到了使用 method='loess' 的人的其他 Google 结果(以及此处的问题)。

是否有一个详尽的列表来解释这些选项?

据我所知,'lm'画的是一条直线,'loess'画的是一条非常平滑的曲线。我认为还有其他人在参考点之间画了更多锯齿线?

该示例中的 se 参数也不在帮助或在线文档中。

FWIW 这是我的代码。

p <- ggplot(output8, aes(age, myoutcome, group=id, colour=year_diag_cat2)) +
  geom_line() + scale_y_continuous(limits = c(lwr,upr))
p + geom_smooth(aes(group=year_diag_cat2), method="loess", size=2, se=F)

I'm using geom_smooth() from ggplot2.

In Hadley Wickham's book ("ggplot2 - Elegant Graphics for Data Analysis") there is an example (page 51), where method="lm" is used. In the online manual there is no talk of the method argument. I see other Google results (and questions here) of people using method='loess'.

Is there a an exhaustive list somewhere that explains the options?

From what I can see, 'lm' draws a straight line, and 'loess' draws a very smooth curve. I assume there are others that draw more of a jagged line between reference points?

The se argument from the example also isn't in the help or online documentation.

FWIW here is my code.

p <- ggplot(output8, aes(age, myoutcome, group=id, colour=year_diag_cat2)) +
  geom_line() + scale_y_continuous(limits = c(lwr,upr))
p + geom_smooth(aes(group=year_diag_cat2), method="loess", size=2, se=F)

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评论(3

秋叶绚丽 2024-12-05 12:57:37

有时,提出问题才能让答案跳出来。 ggplot2 wiki stat_smooth 页面 上列出了方法和额外参数。

geom_smooth() 页面上提到了:

“如果您想了解使用内置模型拟合的示例,请参阅 stat_smooth
需要更灵活,此示例向您展示如何绘制拟合
从您选择的任何型号”。

这不是我第一次在 ggplot 图表的示例中看到参数,这些参数不是专门在函数中的。它确实使计算出每个函数的范围变得困难,或者也许我是还没有偶然发现一个神奇的明确列表,说明每个函数中什么可以工作,什么不可以工作。

Sometimes it's asking the question that makes the answer jump out. The methods and extra arguments are listed on the ggplot2 wiki stat_smooth page.

Which is alluded to on the geom_smooth() page with:

"See stat_smooth for examples of using built in model fitting if you
need some more flexible, this example shows you how to plot the fits
from any model of your choosing".

It's not the first time I've seen arguments in examples for ggplot graphs that aren't specifically in the function. It does make it tough to work out the scope of each function, or maybe I am yet to stumble upon a magic explicit list that says what will and will not work within each function.

夏尔 2024-12-05 12:57:37

方法参数指定平滑统计的参数。您可以查看 stat_smooth 以获取所有可能参数的列表到方法参数。

The method argument specifies the parameter of the smooth statistic. You can see stat_smooth for the list of all possible arguments to the method argument.

美人骨 2024-12-05 12:57:37

示例中的 se 参数也不在帮助或在线文档中。

当 geom_smooth 中的“se”设置为“FALSE”时,错误着色区域不可见

The se argument from the example also isn't in the help or online documentation.

When 'se' in geom_smooth is set 'FALSE', the error shading region is not visible

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