如何使用 ggplot 绘制多个 ecdf？

Question

我有一些数据格式如下：

    2     2
    2     1
    2     1
    2     1
    2     1
    2     1
    2     2
    2     1
    2     1
    2     1
    2     2
    2     2
    2     1
    2     1
    2     2
    2     2
    2     1
    2     1
    2     1
    2     1
    2     1
    2     1
    2     1
    3     1
    3     1
    3     1
    3     3
    3     2
    3     2
    4     4
    4     2
    4     4
    4     2
    4     4
    4     2
    4     2
    4     4
    4     2
    4     2
    4     1
    4     1
    4     2
    4     3
    4     1
    4     3
    6     1
    6     1
    6     2
    7     1
    7     1
    7     1
    7     1
    7     1
    8     2
    8     2
    8     2
    8     2
    8     2
    8     2
   12     1
   12     1
   12     1
   12     1
   12     1

我试图为第一列中的每个不同值绘制此数据集的 ecdf 。因此，在这种情况下，我想在图表上绘制 7 条 ecdf 曲线（一条代表第一列中包含 2 的所有点，一条代表第一列中包含 3 的所有点，依此类推...）。对于一列，我可以使用以下命令绘制 ecdf：

data = read.table("./test", header=F)
data1 = data[data$V1 == 2,]
qplot(unique(data1$V2), ecdf(data1$V2)(unique(data1$V2)), geom='step')

但我无法理解如何绘制多条曲线。有什么建议吗？

Answer 1

如果您不再使用 qplot()，会更容易：

library(plyr)
library(ggplot2)
d.f <- data.frame(
  grp = as.factor( rep( c("A","B"), each=40 ) ) ,
  val = c( sample(c(2:4,6:8,12),40,replace=TRUE), sample(1:4,40,replace=TRUE) )
  )
d.f <- arrange(d.f,grp,val)
d.f.ecdf <- ddply(d.f, .(grp), transform, ecdf=ecdf(val)(val) )

p <- ggplot( d.f.ecdf, aes(val, ecdf, colour = grp) )
p + geom_step()

您还可以轻松添加 facet_wrap 来表示多个组，并添加 xlab/ylab 来表示标签。

d.f <- data.frame(
  grp = as.factor( rep( c("A","B"), each=120 ) ) ,
  grp2 = as.factor( rep( c("cat","dog","elephant"), 40 ) ) ,
  val = c( sample(c(2:4,6:8,12),120,replace=TRUE), sample(1:4,120,replace=TRUE) )
  )
d.f <- arrange(d.f,grp,grp2,val)
d.f.ecdf <- ddply(d.f, .(grp,grp2), transform, ecdf=ecdf(val)(val) )

p <- ggplot( d.f.ecdf, aes(val, ecdf, colour = grp) )
p + geom_step() + facet_wrap( ~grp2 )

Answer 2

自 2012 年底以来，ggplot2 包含了用于打印 ecdfs 的专用函数：ggplot2 文档。

那里的示例甚至比 Ari 的好解决方案还要短：

df <- data.frame(x = c(rnorm(100, 0, 3), rnorm(100, 0, 10)),
             g = gl(2, 100))
ggplot(df, aes(x, colour = g)) + stat_ecdf()