R 实例失败 +远程数据库连接

发布于 2024-11-24 05:18:03 字数 181 浏览 4 评论 0原文

简单问题：我使用 RODBC 连接以批处理模式并行运行多个 R 实例，并且随机一个（或多个）实例出现故障。如果我回去一一运行实例，所有实例都会成功。日志中没有错误，我只是想推断问题到底出在哪里。我的主要假设是，我遇到了内存堆顶部并且实例失败，或者（更有可能）RODCB 连接发生某种超时。有什么建议吗？

谢谢，

吉姆

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南巷近海 2024-12-01 05:18:03

目前尚不清楚为什么没有错误显示，也许您可以尝试 options(error = recovery)

我曾经在使用多个数据库连接时收到以下错误：

Error in mysqlExecStatement(conn, statement, ...) : 
  RS-DBI driver: (connection with pending rows, close resultSet before continuing)

我通过发出以下行来关闭来避免此错误在发出新查询之前是否有任何打开的连接：

lapply(dbListConnections(MySQL()), dbDisconnect)

我从获取此代码帮助列表。

更新：我的一位合作者创建了函数套件促进数据库交互，包括db.con、db.open、db.close和db.query > 可以这样使用：

## load functions
source("https://raw.github.com/PecanProject/pecan/master/db/R/utils.R")

## example
params <- list(dbname = "mydb", username = "myname", password = "!#@?$")
con <- db.open(params)
mydata <- db.query("select * from mytable;")
db.close(con)

It is not clear why no error shows, perhaps you could try options(error = recover)

I used to get the following error when using multiple database connections:

Error in mysqlExecStatement(conn, statement, ...) : 
  RS-DBI driver: (connection with pending rows, close resultSet before continuing)

I avoid this error by issuing the following line to close any open connections before issuing a new query:

lapply(dbListConnections(MySQL()), dbDisconnect)

I took this code from the R help list.

update: one of my collaborators has created a suite of functions to facilitate database interactions, including db.con, db.open, db.close, and db.query that could be used like:

## load functions
source("https://raw.github.com/PecanProject/pecan/master/db/R/utils.R")

## example
params <- list(dbname = "mydb", username = "myname", password = "!#@?$")
con <- db.open(params)
mydata <- db.query("select * from mytable;")
db.close(con)

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