如何从 python 访问 matlab/octave 模块？

Question

我正在寻找一种从 python 访问 matlab 模块的方法。我目前的情况是这样的：

• 我有一个 python 代码，它通过调用 Lapack 例程来进行数值计算，同时内存被分配为 ctypes 并作为指针传递给 Lapack 例程。
• 我还有一个与 Octave 兼容的 matlab 模块，它可以执行一些我想使用的数学技巧。

我现在的问题是：
有什么有效的方法可以将所有主要工作保留在 python 中，同时利用 matlab/octave 模块提供的可能性。如果我的 ctype 数组不必转换为其他对象即可运行八度音程，那就太好了。然而，我可以看到最后一点很难实现。

我目前的研究向我展示了两种可能的选择：

1. Pytave：然而，这个包似乎是预阿尔法？！
2. 走这条崎岖的路：ctypes -> *.mat 文件（通过 numpy）->八度 -> *.mat 文件 -> ctypes（通过 numpy）

Answer 1

您可以使用 oct2py，IIUC 是由其作者启动的，因为 pytave 无法在 win32 上运行。它通过其 octavemagic 扩展 在 IPython 中成功使用，我可以说它很容易单独使用，代码得到维护（我报告了一点 Unicode 错误，作者在一天内修复了它）并且运行良好。大多数时候很简单：

>>> from oct2py import octave
>>> octave.run("cos(pi / 3)")
'ans =  0.50000'
>>> octave.call("foo", a, b)  # Function in foo.m

有关更多示例，您可以查看这篇博客文章< /a>.

Answer 2

您是否考虑过使用 OMPC http://ompc.juricap.com/ ？当我不想重写一些数值线性代数例程时，我使用它取得了巨大的成功。我可以想象，Matlab 命令越深奥，翻译起来就越困难……但这可能值得一试。最后，您需要将 Matlab 代码转换为 Python，因为它将成为速度和性能的瓶颈。将 Matlab 代码保留为 Matlab 格式的唯一原因是，如果将其全部翻译起来会产生巨大的前期成本，OMPC 应该在一定程度上减轻这一成本。否则，为了完全摆脱 Matlab/Octave 的依赖而付出的前期成本几乎总是值得的。

Answer 3

我在让 OMPC 工作时遇到了一些麻烦，因为 (I) md5 模块已被弃用，(II) Python 2.6 及更高版本不再接受 Object.__new__() 或 Object.__init__() 的参数，以及 (III) byteplay.py脚本需要更新。

为了解决问题 (I)，我更改了 ompc/ 目录中的 yacc.py 的第 74 行。该行导入 md5 等。我删除了 md5 模块并添加了以下行：

from hashlib import md5

稍后在 yacc.py 脚本中的第 1160 行，我将其更改

Signature = md5.new()

为以下内容：

Signature = md5()

要运行 ompcply.py 生成的代码，请将“from ompc import *”添加到开头的文件，然后使用早期版本的 Python 运行它，如下所示：

$ python2.5 ompcply.py script.m > newscript.pym
$ python2.5 newscript.pym

使用高于 2.5 的 Python 版本将给出以下错误：

/home/connor/downloads/OMPC/ompclib/ompclib_numpy.py:66: DeprecationWarning: object.__new__() takes no parameters
  a = super(mvar, cls).__new__(cls, *args, **kwargs)

为了解决问题 (III)，我在 google 上搜索了 byteplay，并将现有脚本替换为较新的版本。