如何用python计算文件中两个字符之间的行号？

Question

嗨 我是 python 新手，我有一个 3.2 python！ 我有一个具有如下格式的文件：

Number of segment pairs = 108570; number of pairwise comparisons = 54234
'+' means given segment; '-' means reverse complement

Overlaps            Containments  No. of Constraints Supporting Overlap

******************* Contig 1 ********************

 E_180+

 E_97-

******************* Contig 2 ********************

E_254+

                    E_264+ is in E_254+

E_276+

******************* Contig 3 ********************

E_256-

E_179-

我想计算 *****< 之间的非空行数em>contig#**** 我想要得到这样的结果

contig1=2
contig2=3
contig3=2**

Answer 1

也许，这里最好使用正则表达式。您可以尝试以下操作：

import re
str = open(file).read()
pairs = re.findall(r'\*+ (Contig \d+) \*+\n([^*]*)',str)

pairs 是元组列表，其中元组的形式为('Contig x', '...')
每个元组的第二个组成部分包含标记后面的文本

。之后，您可以计算这些文本中 '\n' 的数量；最简单的是，这可以通过列表理解来完成：（

[(contig, txt.count('\n')) for (contig,txt) in pairs]

编辑：如果你不想计算空行，你可以尝试

[(contig, txt.count('\n')-txt.count('\n\n')) for (contig,txt) in pairs]

：）

Answer 2

def give(filename):
    with open(filename) as f:
        for line in f:
            if 'Contig' in line:
                category = line.strip('* \r\n')
                break
        cnt = 0
        aim = []
        for line in f:
            if 'Contig' in line:
                yield (category+'='+str(cnt),aim)
                category = line.strip('* \r\n')
                cnt = 0
                aim= []
            elif line.strip():
                cnt+=1
                if 'is in' in line:
                    aim.append(line.strip())
        yield (category+'='+str(cnt),aim)


for a,b in give('input.txt'):
    print a
    if b:  print b

result

Contig 1=2
Contig 2=3
['E_264+ is in E_254+']
Contig 3=2

函数give() 不是一个普通函数，它是一个生成器函数。看看医生，如果你有问题，我会回答。

strip() 是一个消除字符串开头和结尾字符的函数。

当不带参数使用时，strip() 会删除空格（也就是说 < code>\f \n \r \t \v 和 空格）。当存在字符串作为参数时，在处理的字符串中找到的字符串参数中存在的所有字符都将从处理的字符串中删除。字符串参数中的字符顺序并不重要：此类参数并不指定字符串，而是指定要删除的一组字符。

line.strip() 是一种了解行中是否存在非空白字符的方法

elif line.strip(): 位于行 if 'Contig' in line: ，并且它被写成 elif 而不是 if ，这一点很重要：如果相反，<例如， code>line.strip() 将为 True ，

******** Contig 2 *********\n

我想您会有兴趣了解像这样的行的内容：

            E_264+ is in E_254+

因为它是这样的对计数产生影响的线
所以我编辑了我的代码，以便函数 give() 也产生这些类型的行的信息