不同的爆炸工具
我目前正在寻找商业与非商业喷砂工具。我曾多次使用 NCBI 爆炸进行本地爆炸搜索，但现在我正在寻找有趣的替代方案。在搜索过程中，我发现了一些有趣的结果，例如 CUDA-Blast、GPU-Blast、WU-Blast、BlastStation2、mpiBlast 和 Turboblast。有人使用过这些工具吗？或者是否有我错过的类似工具，例如 BlastStation2？我错过了任何重要的商业或非商业爆炸工具吗？
我真的很感谢你的帮助。
谢谢，
贝思
I am currently looking for commercial vs. non-commercial blast tools. I've used several times the NCBI blast for my local blast searches but now I am looking for interesting alternatives. During my search I found some interesting results such as CUDA-Blast, GPU-Blast, WU-Blast, BlastStation2, mpiBlast and Turboblast. As anyone experiences with those tools? Or are there any similar tools such as BlastStation2 available, that I missed? Any important commercial or non-commercial blast tools I missed?
I really appreciate your help.
Thanks,
Beeth
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评论（2）
您可能需要查看 http://www.sequenceserver.com
它是开源的。它使得快速设置本地 BLAST 服务器变得非常容易，您可以通过该服务器获得 Web 界面。 （这意味着您也可以与同事分享）。
免责声明：我是开发人员之一。
干杯，
雅尼克
you may want to check out http://www.sequenceserver.com
It's open source. It makes it really easy to rapidly set up a local BLAST server to which you get a web interface. (Meaning that you can share it with colleagues too).
Disclaimer: I'm one of the developers.
Cheers,
Yannick
您还应该看看 FASTA 程序，它提供相同的比较功能等等。 FASTA 程序可以生成 BLAST 输出，因此分析管道需要最少的修改。
http://faculty.virginia.edu/wrpearson/fasta
You should also take a look at the FASTA programs, which provide the same comparison functions, and more. The FASTA programs can produce BLAST output, so analysis pipelines need minimal modification.
http://faculty.virginia.edu/wrpearson/fasta