R-“原理计算”只能与比变量更多的单位一起使用

Question

我正在使用 R 软件（R Commander）对我的数据进行聚类。我的数据有一个较小的子集，包含 200 行和大约 800 列。尝试 kmeans 聚类并在图表上绘制时出现以下错误。 “‘princomp’只能与比变量更多的单位一起使用”

然后我创建了一个 10 行和 10 列的测试文档，它绘制得很好，但是当我添加额外的列时，我再次收到错误。 这是为什么呢？我需要能够绘制我的集群。当我在对数据集执行 kmeans 后查看数据集时，我可以看到额外的结果列，其中显示它们属于哪些集群。

我做错了什么吗，我可以摆脱这个错误并绘制更大的样本吗？？？ 请帮忙，已经让我头疼了一个星期了。 谢谢你们。

Answer 1

问题在于变量多于样本点，并且正在进行的主成分分析失败。

在 princomp 的帮助文件中，它解释了（阅读 ?princomp）：

 ‘princomp’ only handles so-called R-mode PCA, that is feature
 extraction of variables.  If a data matrix is supplied (possibly
 via a formula) it is required that there are at least as many
 units as variables.  For Q-mode PCA use ‘prcomp’.

Answer 2

如果样本少于数据点，则主成分分析未指定。
每个数据点都将是它自己的主要组成部分。为了使 PCA 发挥作用，实例的数量应明显大于维度的数量。

简单来说，你可以这样看待问题：
如果您有 n 维度，则可以使用全部为 0 或最多具有一个 的向量对最多 n+1 个实例进行编码>1。而且这是最优的，所以 PCA 就会这样做！但这并没有多大帮助。

Answer 3

您可以使用 prcomp 代替 princomp