如何获取在 RStudio 中运行的脚本的所有输出

发布于 2024-10-31 03:30:44 字数 573 浏览 2 评论 0原文

我想查看 149 行脚本的输出。在整个脚本中都有我想查看的表格。我正在使用 RStudio IDE。过去我用过Tinn-R。我将运行整个脚本，代码行和打印的对象将在控制台中可见。

例如，这是摘录

attach(uniquehuman.race.eth)
partA.eth <-table(Ethnicity, Sex,useNA="ifany")
partA.eth
margin.table(partA.eth,1)#row totals
margin.table(partA.eth,2)#column totals
nrow(uniquehuman.race.eth)#total logged in

上面的代码将给出表格的文本输出和我需要的数字。然后我可以保存控制台或将整个内容复制并粘贴到文本文件中。

我怎样才能在 RStudio 中做到这一点？我最接近的方法是在每一行上按 CTRL-ENTER，但我不想这样做 149 次。如果我按 CTRL-SHIFT-ENTER 键“运行全部”，则 R 会处理所有数据并将对象放入内存中，但我看不到输出。

请告诉我如何查看所有输出和/或将输出发送到文本文件。

原文

I want to see the output of a script that has 149 lines. All the way through the script there are tables that I want to see. I am using RStudio IDE. In the past I have used Tinn-R. I would run the whole script and the lines of code and the printed objects would be visible in the console.

For instance, here is an excerpt

attach(uniquehuman.race.eth)
partA.eth <-table(Ethnicity, Sex,useNA="ifany")
partA.eth
margin.table(partA.eth,1)#row totals
margin.table(partA.eth,2)#column totals
nrow(uniquehuman.race.eth)#total logged in

The above code would give a text output of the tables and the numbers I needed. I could then save the console or copy and paste the whole thing in a text file.

How can I do that in RStudio? The closest I come to it is hitting CTRL-ENTER on each line, but I do not want to do that 149 times. If I hit CTRL-SHIFT-ENTER for "run all", then R processes all the data and puts the objects into memory, but I do not see the output.

Please tell me how I can see all the output and/or send the output to a text file.

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半步萧音过轻尘 2024-11-07 03:30:44

我是 RStudio 开发人员之一。感谢您的反馈——我将记录一个错误。

与此同时，一种解决方法是从控制台执行 source(filename, echo=T)。

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此生挚爱伱 2024-11-07 03:30:44

您只需选择要运行的代码，然后按 CTRL+ENTER 即可在 RStudio 中执行您想要的操作。这适用于多行，就像 Tinn-R 中一样。如果您想以详细方式一次运行所有内容，请按 CTRL-A CTRL-ENTER。

作为保存到文本文件的另一个选项，您可以检查 ?sink ：

sink(file='path/to/somefile.ext')
... # the code generating output
sink()

sink() 将控制台的所有输出重定向到连接，在本例中是某个文件。请注意，这只是标准输出，而不是警告或错误。该命令还可以与 print()、cat()、sprintf() 等结合使用，在分析中创建输出文件。

如果您在 RStudio 中使用“run all”，则必须显式使用任何提到的函数来生成文件的输出。原则上，如果您运行整个脚本，RStudio 会静默运行。

You can simply select the code you want to run and press CTRL+ENTER to do what you want in RStudio. This works for multiple lines, exactly like in Tinn-R. If you want to run everything at once in a verbose way, you press CTRL-A CTRL-ENTER.

As another option for saving to a text file, you can check ?sink :

sink(file='path/to/somefile.ext')
... # the code generating output
sink()

sink() redirects all output of the console to a connection, in this case some file. Mind you, this is only the standard output, not the warnings or errors. This command also come in handy to create output files in analyses, in combination with print(), cat(), sprintf() etc.

If you use "run all" in RStudio, you have to explicitly use any of the mentioned functions to generate the output to the file. In principle, RStudio runs silently if you run the whole script.

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