ubuntu中R包安装

Question

这里有点新手。我一直在 Windows 的 R 中工作，最近搬到了 ubuntu（我认为是“Hardy Heron”）。我也不是linux人。反正。我正在尝试安装“diptest”包。我运行命令

install.packages("diptest") 

，输出是：

将软件包安装到“/home/smart/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.6”中 （因为“lib”未指定） 这有点奇怪，因为我运行的是 R 2.12.1。然后它挂起。

另外，如果我调用library("diptest")，它会说我需要重新安装该包，因为它是为 R 2.6 构建的。重新安装的过程与 install.packages 不同吗？谢谢。抱歉问这么简单的问题。

Answer 1

重新安装的过程与安装完全相同，即 install.packages("diptest")。您可能需要使用选项repos来指向正确的存储库。似乎有什么不对劲的地方。 AFAIK R 使用该版本的正确存储库，但您的安装可能会出现一些奇怪的情况。确保您按照此处在 debian 上安装 R 的说明进行操作。

因此，对于我的存储库来说：

install.packages("diptest",
   repos="http://www.freestatistics.org/cran/bin/windows/contrib/2.12")

您可以使用命令 packageStatus() 获取一些信息。这还应该为您提供存储库，例如：

> update(packageStatus())
Number of installed packages:

                         ok upgrade unavailable
  E:/R/Library          111       1           2
  C:/R/R-2.12.2/library  26       2           0

Number of available packages (each package counted only once):

                                                              installed not installed
  http://www.freestatistics.org/cran/bin/windows/contrib/2.12        99          2791
  http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin/bin/windows/contrib/2.12         3            12

如果可以，您可以检查该软件包是否实际安装：

"diptest" %in% installed.packages()

如果是，您可以使用 old.packages() 检查是否可以找到更新的软件包版本。

> old.packages()
         Package    LibPath                 Installed     Built    ReposVer     
survival "survival" "E:/R/Library"          "2.36-2"      "2.12.1" "2.36-5"     
lattice  "lattice"  "C:/R/R-2.12.2/library" "0.19-17"     "2.12.2" "0.19-23"    
Matrix   "Matrix"   "C:/R/R-2.12.2/library" "0.999375-46" "2.12.2" "0.999375-49"
         Repository                                                   
survival "http://www.freestatistics.org/cran/bin/windows/contrib/2.12"
lattice  "http://www.freestatistics.org/cran/bin/windows/contrib/2.12"
Matrix   "http://www.freestatistics.org/cran/bin/windows/contrib/2.12"

如果是这样，您可以使用

install.packages("diptest")

更新所有版本

update.packages()

安装新版本，也可以使用HTH