XSLT 中的嵌套循环
我尝试在 XSL 文件中执行嵌套循环,但在多次尝试后卡住了
我的 xml 文件是这样的
<chromosome cnumber="X" cstart="10000" cend="1000000">
<gene>
<gname>ENSG00000216667</gname>
<gstart>100411</gstart>
<gend>102713</gend>
<external_ref>
<one>OTTG:OTTHUMG00000046372</one>
<two>HGNC:CXYorf11</two>
<three>HGNC_curated_gene:CXYorf11</three>
</external_ref>
<transcript>
<tname>ENST00000406851</tname>
<tstart>100411</tstart>
<tend>102713</tend>
<tstrand>+1</tstrand>
</transcript>
</gene>
<gene>
<gname>ENSG00000182378</gname>
<gstart>122990</gstart>
<gend>150024</gend>
<external_ref>
<one>UCSC:uc004cpa.1</one>
<two>UCSC:uc004cpb.1</two>
<three>HGNC:PLCXD1</three>
<four>HGNC_automatic_gene:PLCXD1</four>
</external_ref>
<transcript>
<tname>ENST00000381657</tname>
<tstart>127860</tstart>
<tend>150024</tend>
<tstrand>+1</tstrand>
</transcript>
<transcript>
<tname>ENST00000399012</tname>
<tstart>122990</tstart>
<tend>150021</tend>
<tstrand>+1</tstrand>
</transcript>
<transcript>
<tname>ENST00000381663</tname>
<tstart>122992</tstart>
<tend>150021</tend>
<tstrand>+1</tstrand>
</transcript>
</gene>
<gene>
<gname>ENSG00000214798</gname>
<gstart>148481</gstart>
<gend>149027</gend>
<external_ref>
<one>UCSC:uc004cpc.1</one>
<two>Clone_based_ensembl_gene:BX000483.7</two>
</external_ref>
<transcript>
<tname>ENST00000399005</tname>
<tstart>148481</tstart>
<tend>149027</tend>
<tstrand>+1</tstrand>
</transcript>
</gene>
<gene>
<gname>ENSG00000178605</gname>
<gstart>150026</gstart>
<gend>160887 </gend>
<external_ref>
<one>UCSC:uc004cpe.1</one>
<two>HGNC:GTPBP6</two>
<three>HGNC_automatic_gene:GTPBP6</three>
</external_ref>
<transcript>
<tname>ENST00000326153</tname>
<tstart>150026</tstart>
<tend>160887</tend>
<tstrand>-1</tstrand>
</transcript>
</gene>
<gene>
我在这里尝试了 XSLT 这种方式
<xsl:for-each select="chromosome/gene">
Name: <xsl:value-of select="gname" /> <br />
Start Region: <xsl:value-of select="gstart" /> <br />
End Region: <xsl:value-of select="gend" /> <br />
<xsl:value-of select="external_ref/one "/><br />
<xsl:value-of select="external_ref/two "/>
<xsl:if test="external_ref/three !=' '"><br/>
<xsl:value-of select="external_ref/three "/>
</xsl:if>
<xsl:if test="external_ref/four !=' '"><br/>
<xsl:value-of select="external_ref/four "/>
</xsl:if>
<xsl:for-each select="chromosome/gene/transcript">
Name:<xsl:value-of select="tname" /></strong> <br />
Start Region: <xsl:value-of select="tstart" /> <br />
End Region: <xsl:value-of select="tend" /> <br />
Strand: <xsl:value-of select="tstrand" />
</xsl:for-each>
</xsl:for-each>
问题是我没有得到任何成绩单;当我在顶部的每个循环只使用一个时,我只从 xml 列表中得到一份不完整的记录,
你们能指出我的错误吗,我对 XSLT 完全陌生。
谢谢
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评论(1)
通过外部 循环,您已经处于染色体/基因级别。将其视为文件系统中的“更改为该目录”。
当您想要从其中获取转录本时,您只需选择以下选项:
With the outer
<xsl:for-each
loop you already stand at the level of chromosome/gene. Think of it as in "changing into that directory" in a file system.When you want the transcript from within there, you need to only select this like: