strsplit符号“|”导致 R 中的非字符错误消息

Question

非常感谢您的帮助。

是的。我应该提供一个更好的例子。

这是我的输入文件 (3columns.csv)

    Patients    Markers Studies
1   AA         EXX         1111
2   BB         ABCB1           2222|3333|5555|6666
3   CC         CCAN        4444|5555
4   DD         ABCB1           6666

这是我的输出文件

    Patients    Markers Studies
1   AA         EXX         1111
2   BB         ABCB1           2222
2   BB         ABCB1           3333
2   BB         ABCB1           5555
2   BB         ABCB1           6666
3   CC         CCAN        4444
3   CC         CCAN        5555
4   DD         ABCB1           6666

(1) 根据下面的命令，我对第 6 行进行了一些更改，如下

sapply(unlist(strsplit(as.character(df[x,3]),"\\|")),c,df[x,1:2],USE.NAMES=FALSE) 

(2) 我尝试将 df 文件调用为

df <- read.csv(file="3columns.csv",header=TRUE,stringsAsFactors=FALSE)

(3)我还尝试在 | 之前添加 \\

所有这些方法都不起作用，所以我怀疑我可能误解了下面的回复。您介意给我更多指导吗？

此致， Catherine

------原始问题--------------------------

我想使用 R 的 strsplit 命令根据符号“|”分隔单元格。

但是，出现错误消息：

Error in strsplit(df[x, 3], "|") : non-character argument.

此错误消息是什么意思？

我该如何纠正这个错误？

我使用的是本网站上一个问题中列出的命令行：

> write.csv(df, file="3columns.csv")
> as.data.frame(   
+ t(     
+ do.call(cbind,       
+ lapply(1:nrow(df),function(x){         
+ sapply(unlist(strsplit(df[x,3],"|")),c,df[x,1:2],USE.NAMES=FALSE)       
+ })     
+ )   
+ ) 
+ )

Answer 1

如果没有最小的可重现示例，很难看出到底出了什么问题。但是 strsplit(df[x, 3], "|") 不起作用，因为 | 符号是字符中的特殊情况（or 的正则表达式）。你实际上需要双重转义：

strsplit("ab|cd",split="\\|")

Answer 2

| 是正则表达式中使用的特殊字符。您需要使用 \\ 转义 | 以获得您想要的效果：

x <- "abc|xyz|123|456|foo|bar|baz|bat|wheee"

strsplit(x, "\\|")

[[1]]
[1] "abc"   "xyz"   "123"   "456"   "foo"   "bar"   "baz"   "bat"   "wheee"

请参阅 ?regex 并搜索“特殊字符”查找整个字符列表。