在服务器上调用 R 从主机上的 R 会话中提取数据？
背景
我有一个在主机上运行的 R 脚本，并在服务器上启动作业。这些作业输出大型 hdf5 文件。
我剩下的工作都是在主机上完成的。但是，R hdf5 库只能在服务器上运行，而不能在主机上运行（由于已知的 bug）。
我可以从主机上的 R 连接到服务器上的 R 会话、加载 R hdf5 库、从 hdf5 文件中提取数据，然后将此对象传递给主机吗？
当前的方法
我当前的组合是从 R 中调用 bash 脚本，该脚本调用服务器上的 R 脚本并提取到 Rdata 文件，然后使用 rsync 将其带回主机（全部在 system() 内））
问题
有没有更好的方法从服务器上的这些 hdf5 文件中提取数据？
我正在考虑像在调试时进入浏览器会话一样进入服务器 R 会话。
Background
I have an R script that runs on a host, and starts jobs on a server. The jobs output large hdf5 files.
The rest of my work is done on the host. However, the R hdf5 libraries only work on the server and not the host (because of a known bug).
From R on the host, can I connect to an R session on the server, load the R hdf5 libraries, extract data from an hdf5 file, and then pass this object to the host?
Current approach
My current kludge is to call a bash script from within R that invokes an R script on the server and does the extraction to Rdata files, and then use rsync to bring it back to the host (all within system())
Question
Is there a better way to extract data from these hdf5 files on the server?
I am thinking of something like entering a server R session in the same way that I can enter the browser session when debugging.
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发布评论
评论（1）
Rserve怎么样，或者有使用视频svSocket 用于在 < 上的客户端和服务器之间传递数据一个href="http://datatable.r-forge.r-project.org/" rel="nofollow">data.table 主页。
How about Rserve, or there is a video of using svSocket for passing data between client and server on the data.table homepage.