如何禁用科学记数法？

Question

我有一个包含 p 值列的数据框，我想对这些 p 值进行选择。

> pvalues_anova
[1] 9.693919e-01 9.781728e-01 9.918415e-01 9.716883e-01 1.667183e-02
[6] 9.952762e-02 5.386854e-01 9.997699e-01 8.714044e-01 7.211856e-01
[11] 9.536330e-01 9.239667e-01 9.645590e-01 9.478572e-01 6.243775e-01
[16] 5.608563e-01 1.371190e-04 9.601970e-01 9.988648e-01 9.698365e-01
[21] 2.795891e-06 1.290176e-01 7.125751e-01 5.193604e-01 4.835312e-04

选择方式：

anovatest<- results[ - which(results$pvalues_anova < 0.8) ,]

如果我在 R 中使用它，该函数工作得很好。但是如果我在另一个应用程序（galaxy）中运行它，则没有 e-01 的数字，例如 4.835312e -04 不会被丢弃。

是否有另一种方法来表示 p 值，例如 0.0004835312 而不是 4.835312e-04？

Answer 1

您可以使用以下代码有效地删除打印中的科学记数法：

options(scipen=999)

Answer 2

format(99999999,scientific = FALSE)

给出

99999999

Answer 3

总结所有现有答案

（并添加一些我的观点）

注意：在下面的解释中，value 是以某种（整数/浮点）格式表示的数字。

解决方案 1：

options(scipen=999)

解决方案 2：

format(value, scientific=FALSE);

解决方案 3：

as.integer(value);

解决方案 4：

您可以使用不以科学记数法打印的整数。您可以通过在数字后面添加“L”来指定您的数字是整数，

paste(100000L)

将打印 100000

解决方案 5：

使用“sprintf()”严格控制格式

sprintf("%6d", 100000)

将打印 100000

解决方案6：

prettyNum(value, scientific = FALSE, digits = 16)

Answer 4

我还发现，当我不需要尾随零时，prettyNum(..., science = FALSE) 函数对于打印很有用。请注意，这些函数对于打印目的很有用，即这些函数的输出是字符串，而不是数字。

p_value <- c(2.45496e-5, 3e-17, 5.002e-5, 0.3, 123456789.123456789)
format(p_value, scientific = FALSE)
#> [1] "        0.00002454960000000" "        0.00000000000000003"
#> [3] "        0.00005002000000000" "        0.29999999999999999"
#> [5] "123456789.12345679104328156"


format(p_value, scientific = FALSE, drop0trailing = TRUE)
#> [1] "        0.0000245496"        "        0.00000000000000003"
#> [3] "        0.00005002"          "        0.29999999999999999"
#> [5] "123456789.12345679104328156"


# Please note that the last number's last two digits are rounded:
prettyNum(p_value, scientific = FALSE, digits = 16)
#> [1] "0.0000245496"        "0.00000000000000003" "0.00005002"
#> [4] "0.3"                 "123456789.1234568"

Answer 5

除了现有的答案之外，例如，如果有人想在整个列上使用前面提到的 format() 和 dplyr，那么 format() 需要被包裹在 lambda 函数中：

colors <- c("red", "green", "blue", "yellow", "orange")
floats <- runif(5) / 1000000

df <- data.frame(colors, floats) %>% 
  dplyr::mutate_if(is.numeric, function(x) format(x, scientific = FALSE))

Answer 6

@yuskam 将其放在评论中（即使用 withr）。如果您正在开发一个函数/包，这会很有帮助。我在这里回答是为了提高该建议的知名度。

# show standard setting to confirm ground truth
getOption("scipen")

vect <- c(4.835312e-06, 4.835312e-05, 4.835312e-04)
print(vect)

print_non_scientific <- function(x) {
  # show setting within function
  withr::local_options(list(scipen = 999))
  print(getOption("scipen"))
  print(x)
}

print_non_scientific(vect)

# show standard setting to confirm that the function did not change it
getOption("scipen")

我的机器上的输出：

> # show standard setting to confirm ground truth
> getOption("scipen")
[1] 0
> 
> vect <- c(4.835312e-06, 4.835312e-05, 4.835312e-04)
> print(vect)
[1] 4.835312e-06 4.835312e-05 4.835312e-04
> 
> print_non_scientific <- function(x) {
+   # show setting within function
+   withr::local_options(list(scipen = 999))
+   print(getOption("scipen"))
+   print(x)
+ }
> 
> print_non_scientific(vect)
[1] 999
[1] 0.000004835312 0.000048353120 0.000483531200
> 
> # show standard setting to confirm that the function did not change it
> getOption("scipen")
[1] 0