在python中将点转换为png

Question

我有一个从我的代码生成的点文件，并希望在我的输出中呈现它。为此，我在网上看到命令类似于 cmd

dot -Tpng InputFile.dot -o OutputFile.png  for Graphviz

但我的问题是我想在我的 python 程序中使用这个内置命令。

我该怎么办？

我查看了 pydot 但似乎无法在那里找到答案......

Answer 1

使用 pydot.graph_from_dot_file 加载文件以获取 pydot.Dot 类实例。然后使用 write_png 方法将其写入 PNG 文件。

import pydot

(graph,) = pydot.graph_from_dot_file('somefile.dot')
graph.write_png('somefile.png')

Answer 2

pydot 无论如何都需要安装 GraphViz 二进制文件，所以如果您已经生成了点文件您也可以自己直接调用 dot 。例如：

from subprocess import check_call
check_call(['dot','-Tpng','InputFile.dot','-o','OutputFile.png'])

Answer 3

您可以使用pygraphviz。加载图表后，您可以执行以下操作

graph.draw('file.png')

Answer 4

您可以使用 graphviz：

# Convert a .dot file to .png
from graphviz import render
render('dot', 'png', 'fname.dot')

# To render an existing file in a notebook
from graphviz import Source
Source.from_file("fname.dot")

Answer 5

您可以尝试：

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'C:/Program Files (x86)/Graphviz2.38/bin/'
os.system('dot -Tpng random.dot -o random.png')

Answer 6

第一个解决方案）

通过在脚本内设置 PATH 进一步采用 @Mauricio Carrero 的方法（在环境变量中设置的相同 PATH 没有此效果！）：

import os
import pydotplus
from sklearn.tree import export_graphviz

os.environ['PATH'] = os.environ['PATH']+';' + r'C:\Users\Admin\Anaconda3\Library\bin\graphviz'

# first export the dot file only if needed
export_graphviz(clf, out_file=filename + ".dot", feature_names = feature_names)
# now generate the dot_data again
dot_data = export_graphviz(clf, out_file=None, feature_names = feature_names)
graph = pydotplus.graphviz.graph_from_dot_data(dot_data)
graph.write_png(filename + "_gv.png")

这使得将 dot_data 保存为 png 成为可能。选择你自己的本地路径，你可能还已经在 `C:/Program Files (x86)/Graphviz2.38/bin/ 这个解决方案中安装了 graphviz

这个解决方案也来自 Sarunas 的回答：
https://datascience.stackexchange.com/ questions/37428/graphviz-not-working-when-imported-inside-pydotplus-graphvizs-executables-not

第二个解决方案）

您还可以通过简单地提供它想要的东西来避免错误

Exception has occurred: InvocationException
GraphViz's executables not found

，因为它要求可执行文件graphviz 对象的：

graph = pydotplus.graphviz.graph_from_dot_data(dot_data)
# graph is now a new Dot object!
# That is why we need to set_graphviz_executables for every new instance
# This cannot be set globally but must be set again and again
# that is why the PATH solution (1st Solution) above seems much better to me
# see the docs in https://pydotplus.readthedocs.io/reference.html
pathCur = 'C:\\Program Files (x86)\\Graphviz2.38\\bin\\'
graph.set_graphviz_executables({'dot': pathCur+'dot.exe', 'twopi': pathCur +'twopi.exe', 'neato': pathCur+'neato.exe', 'circo': pathCur+'circo.exe', 'fdp': pathCur+'fdp.exe'})
graph.write_png(filename + "_gv.png")

ps：
经过 2 个小时的校准错误安装、完全卸载并再次安装、各种 PATH 变量、外部和内部 graphviz 安装、python-graphviz、pygraphviz 以及我可以找到的所有解决方案之后，这两种方法是唯一对我有用的解决方案在这里，或者在
将决策树直接转换为 png
或在
https://datascience。 stackexchange.com/questions/37428/graphviz-not-working-when-imported-inside-pydotplus-graphvizs-executables-not?newreg=a789aadc5d4b4975949afadd3919fe55

对于 conda python-graphviz，我遇到了持续的安装错误，例如

InvalidArchiveError('Error with archive C:\\Users\\Admin\\Anaconda3\\pkgs\\openssl-1.1.1d-he774522_20ffr2kor\\pkg-openssl-1.1.1d-he774522_2.tar.zst.  You probably need to delete and re-download or re-create this file.  Message from libarchive was:\n\nCould not unlink')

For conda install graphviz，我得到

InvalidArchiveError('Error with archive C:\\Users\\Admin\\Anaconda3\\pkgs\\openssl-1.1.1d-he774522_21ww0bpcs\\pkg-openssl-1.1.1d-he774522_2.tar.zst.  You probably need to delete and re-download or re-create this file.  Message from libarchive was:\n\nCould not unlink')

pygraphviz 需要 MS Visual C++，但我不想安装：

error: Microsoft Visual C++ 14.0 is required. Get it with "Microsoft Visual C++ Build Tools": https://visualstudio.microsoft.com/downloads/

最后，除了第一个解决方案方法之外，没有指南能够真正正确地设置 PATH 变量。

Answer 7

这是使用 venv python 3.8 解释器使用 pycharm 终端在 Windows 11 系统上为我工作的代码。

from graphviz import render
import os
os.environ['PATH'] = os.environ['PATH']+';' + r"C:\Program Files\Graphviz\bin" #find binaries of graphviz and add to path
render('dot','png','classes.dot')

这将创建一个classes.dot.pg文件（我不知道如何修复名称，但这是一个可以打开的png文件）

类点是在终端上生成的

pyreverse 包路径

与 pylint 一起提供。

安装：

pip 安装 pylint

（仅当您创建classes.dot 文件时才安装 pylint）

pip 安装 graphviz

Answer 8

这将创建一个图表“a”到“b”并将其保存为 png 文件。

代码：

from graphviz import Digraph

dot = Digraph()
dot.node('a')
dot.node('b')
dot.edge('a','b')

dot. Render("sample.png")

Answer 9

from graphviz import render
dot.render(directory='doctest-output', view=True)