在点图中添加线交叉因子（ggplot）

Question

我正在尝试用与 ggplot 中的因素交叉的线来复制批次/病例/治疗的点图。这类似于 Douglas Bates 线性模型课程中的这个图，它在 y 轴上显示 6 个组，在 x 轴上显示连续响应，每个组的平均值由一条线连接： Dotplot from Bates">

使用与 lme4 包捆绑的 sleepstudy 数据集作为示例，我有：

library(ggplot2)
p <- ggplot(sleepstudy, aes(x=Reaction, y=reorder(Subject, Reaction)))
p <- p + geom_point()
print(p)

然后，我创建一个数据框，其中包含每个受试者的平均反应时间：

mean_rxn <- function(df) mean(df$Reaction, na.rm=T)
sleepsummary <- ddply(sleepstudy, .(Subject), mean_rxn)

我能够在每个受试者的平均值处绘制点：

p.points <- p + geom_point(data=sleepsummary, aes(x=V1, y=reorder(Subject, V1), size=10))
print(p.points)

但我无法获得交叉因素的线。也就是说，从 geom_point 更改为 geom_line 不会显示任何内容

# does nothing
p.line <- p + geom_line(data=sleepsummary, aes(x=V1, y=reorder(Subject, V1)))
print(p.line)

有人有任何想法吗？最终，我的目标是以这种方式在原始数据之上绘制一些模型结果，因此在绘制原始数据帧时“即时”计算的方法不太有用，因为我需要从更复杂的模型拟合。

感谢您的帮助！

瑞安

Answer 1

已编辑

我的第一个建议是在绘图之前将值转换为数字。

p.line <- p + 
  geom_line(data=sleepsummary, aes(x=V1, y=as.numeric(reorder(Subject, V1))))

但 Hadley 指出，最好在解决方案中使用 group=1，而不是 as.numeric()：

p.line <- p + 
  geom_line(data=sleepsummary, aes(x=V1, y=reorder(Subject, V1), group=1))
print(p.line)

Answer 2

您还可以像这样使用 stat_summary ：

require(lme4)
require(ggplot2)

data(sleepstudy)

ggplot(sleepstudy, aes(x = reorder(Subject, Reaction), y = Reaction)) + 
geom_point() + 
stat_summary(fun.y = mean, geom = "line", aes(group = 1)) + 
labs(x = "Subject", y = "Reaction") +
coord_flip()