在 Mac OsX 10.5.8 上安装 rjags 和 JAGS 时出现问题

Question

我在获取 rjags R 包以供 R 调用 JAGS 时遇到问题（只是另一个 Gibbs Sampler http://www-ice.iarc.fr/~martyn/software/jags/）。

我正在运行 Mac Os X.10.5.8 Leopard 并使用 R64 2.12.1。我从命令行编译了 JAGS。然后我在 R 命令行中安装了 rjags。

安装.packages(rjags)

当我尝试在 R 中调用 rjags 时，出现以下错误。

> library(rjags)
  Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rjags', details:
  call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
  error: unable to load shared object '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.12/Resources   /library/rjags/libs/x86_64/rjags.so':
  dlopen(/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.12/Resources/library/rjags/libs/x86_64/rjags.so, 10): Library not loaded: /usr/local/lib/libjags.2.dylib
  Referenced from: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.12/Resources/library/rjags/libs/x86_64/rjags.so
  Reason: no suitable image found.  Did find:
  /usr/local/lib/libjags.2.dylib: mach-o, but wrong architecture
  /usr/local/lib/libjags.2.dylib: mach-o, but wrong architecture
  Error: package/namespace load failed for 'rjags'

我猜测 rjags 引用库中的未知文件存在一些问题，但我不确定。我在命令行方面是一个相当新手，并且对目录很感兴趣，所以任何帮助将不胜感激。

Answer 1

我发现（从 SourceForge 下载并安装 dmg 后）以下命令适用我：

wget http://cran.r-project.org/src/contrib/rjags_2.2.0-4.tar.gz
wget http://cran.r-project.org/src/contrib/R2jags_0.02-15.tar.gz
sudo R --with-jags-modules=/usr/local/lib/JAGS/modules-2.2.0 CMD INSTALL rjags_2.2.0-4.tar.gz
sudo R --with-jags-modules=/usr/local/lib/JAGS/modules-2.2.0 CMD INSTALL R2jags_0.02-15.tar.gz
sudo R --with-jags-modules=/usr/local/lib/JAGS/modules-2.2.0 --arch=i386 CMD INSTALL rjags_2.2.0-4.tar.gz
sudo R --with-jags-modules=/usr/local/lib/JAGS/modules-2.2.0 --arch=x86_64 CMD INSTALL rjags_2.2.0-4.tar.gz

它们当然不是全部必要，但它们已经足够了！

Answer 2

我在运行 Rstudio 0.97.237 和 R 2.15.2 时遇到了同样的问题。这个问题与 JAGS 有关。

修复方法：从此处下载并安装 JAGS 3-3，更新至 JAGS 3-3。

Answer 3

我遇到了错误：无法加载共享对象 '/Library/Frameworks/R.framework/Resources/modules//R_X11.so': 在我的 Mac 上，DuckDuckGo 让我看到了这篇文章。我是从命令行使用 R 的，所以我无法谈论它如何与 RStudio 一起工作，尽管我很确定它也可以解决这个问题。我从另一个答案中提供的 SourceForge 链接更新了 JAGS。我至少可以验证它是否对我有用，尽管开发人员未签名（我需要在安装过程中忽略 MacOS 警告）。