保存 R 项目时的压缩问题

Question

我通过将R安装目录移出C盘解决了这个问题。感谢Joris的出色建议！我认为R核心团队也应该将此视为一个bug，针对windows xp的保护机制做一些事情。

亲爱的社区：

在 R 中使用 BIOMOD 包时，我总是遇到以下问题：

xzfile(file, "wb", compression = 9) 中的错误：无法打开连接 另外：警告消息： 在 xzfile(文件, "wb", 压缩 = 9) 中： 无法初始化lzma编码器，错误5

包的作者以及“save”的帮助文件中都说，该问题应该是由于缺乏写入权限而引起的。但是，由于我以管理帐户登录并对所有操作进行了评估，所以我不知道问题是什么。有人可以帮我吗？我现在确实需要运行该包。先谢谢了~

真诚的， Marco

下面是“保存”帮助文件中的说明：

失败的最常见原因是缺少写入权限 当前目录。用于“save.image”并在最后保存 这将通过以下消息显示：

    Error in gzfile(file, "wb") : unable to open connection
     In addition: Warning message:
     In gzfile(file, "wb") :
       cannot open compressed file '.RDataTmp',
       probable reason 'Permission denied'
 The defaults were changed to use compressed saves for 'save' in
 2.3.0 and for 'save.image' in 2.4.0.  Any recent version of R can
 read compressed save files, and a compressed file can be
 uncompressed (by 'gzip -d') for use with very old versions of R.*

抱歉，遗漏了信息： 这是 sessionInfo()：

> sessionInfo()
R version 2.12.2 (2011-02-25)
Platform: i386-pc-mingw32/i386 (32-bit)

locale:
[1] LC_COLLATE=Chinese_People's Republic of China.936 
[2] LC_CTYPE=Chinese_People's Republic of China.936   
[3] LC_MONETARY=Chinese_People's Republic of China.936
[4] LC_NUMERIC=C                                      
[5] LC_TIME=Chinese_People's Republic of China.936    

attached base packages:
[1] splines   stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods  
[8] base     

other attached packages:
 [1] BIOMOD_1.1-6.8     foreign_0.8-42     gam_1.04          
 [4] randomForest_4.6-2 mda_0.4-1          class_7.3-3       
 [7] gbm_1.6-3.1        lattice_0.19-17    MASS_7.3-11       
[10] Design_2.3-0       Hmisc_3.8-3        survival_2.36-5   
[13] rpart_3.1-48       nnet_7.3-1         ade4_1.4-16       
[16] rgdal_0.6-33       dismo_0.5-19       rJava_0.9-0       
[19] raster_1.7-47      sp_0.9-78         

    loaded via a namespace (and not attached):
    [1] cluster_1.13.3 grid_2.12.2    tools_2.12.2 

现在我发现问题来自 lzma 编码器在执行“保存”时：

>  x<-runif(100)
>  save(x, file = "F:/test.gzip", compress='gzip')
>  save(x, file = "F:/test.xz", compress='xz')
Error in xzfile(file, "wb", compression = 9) : cannot open the connection
> 

Answer 1

使用 8 个模型运行建模过程后，在尝试投影到新场景（包含与预测变量对应的列的表）时，我遇到了类似的问题。

第一个表（大约 250,000 行）运行良好，我能够将结果保存为 .csv 文件。然而，第二个（大约 380,000 行）导致了上述错误消息，并且某些文件未写入项目文件夹。

此后，我已将所有表减少到最多 260,000 行，并且不再收到错误消息。在多次运行中执行此操作有点痛苦，但是一旦我编写了一次脚本，我只需在 MS Word 中使用查找和替换即可在每次运行时更改它。