使用curl向reactome.org发送SOAP查询

Question

（注意：这个问题交叉发布在 Biostar ）

大家好，

我正在尝试将 RPC 编码的 SOAP 查询发送到 Reactome（生物途径数据库），使用curl：

我想调用远程方法 queryPathwaysForReferenceIdentifiers 在 http://www.reactome.org 中定义:8080/caBIOWebApp/services/caBIOService?wsdl

我创建了以下 SOAP/XML 文件：soap.xml

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<SOAP-ENV:Envelope xmlns:xsi="http://www.w3.org/1999/XMLSchema-instance" xmlns:xsd="http://www.w3.org/1999/XMLSchema" xmlns:r="http://www.reactome.org:8080/caBIOWebApp/services/caBIOService" xmlns:SOAP-ENV="http://schemas.xmlsoap.org/soap/envelope/" xmlns:soapenc="http://schemas.xmlsoap.org/soap/encoding/" xmlns:reactome="http://www.reactome.org/caBIOWebApp/schema">
<SOAP-ENV:Body>
<r:queryPathwaysForReferenceIdentifiers>
<r:referenceIdentifiers>
<soapenc:Array soapenc:arrayType="soapenc:string[3]">
<soapenc:string>Q9Y266</soapenc:string>
<soapenc:string>P17480</soapenc:string>
<soapenc:string>P2048</soapenc:string>
</soapenc:Array>
</r:referenceIdentifiers>
</r:queryPathwaysForReferenceIdentifiers>
</SOAP-ENV:Body>
</SOAP-ENV:Envelope>

，并使用以下命令通过curl 发送它：

curl -d @soap.xml \
      -H "Content-Type: application/soap+xml" \
      -H 'SOAPAction: ""' \
      "http://www.reactome.org:8080/caBIOWebApp/services/caBIOService"

但是响应是空的，而我期望的是 结果。

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<soapenv:Envelope xmlns:soapenv="http://schemas.xmlsoap.org/soap/envelope/" xmlns:xsd="http://www.w3.org/1999/XMLSchema" xmlns:xsi="http://www.w3.org/1999/XMLSchema-instance">
  <soapenv:Body>
    <ns1:queryPathwaysForReferenceIdentifiersResponse xmlns:ns1="http://www.reactome.org:8080/caBIOWebApp/services/caBIOService" soapenv:encodingStyle="http://schemas.xmlsoap.org/soap/encoding/">
      <queryPathwaysForReferenceIdentifiersReturn xmlns:ns2="http://www.reactome.org/caBIOWebApp/schema" xmlns:soapenc="http://schemas.xmlsoap.org/soap/encoding/" soapenc:arrayType="ns2:Pathway[0]" xsi:type="soapenc:Array"/>
    </ns1:queryPathwaysForReferenceIdentifiersResponse>
  </soapenv:Body>
</soapenv:Envelope>

我的请求有错误吗？在哪里 ？

非常感谢！

皮埃尔

Answer 1

该问题已在 Biostar 上得到解答：http://biostar.stackexchange.com/questions/5511