解析 uniprot 平面文件
任何人都可以让我知道或帮助解析 uniprot 平面文件并访问注释 (FT) 行中的信息并在 python 脚本中生成输出文件。 FT 线是通用 uniprot 平面文件中描述蛋白质性质的部分。写入此内容的脚本必须生成一个包含该行信息的输出文件。
Can anybody please let me know or help with parsing a uniprot flat file and access the information in the annotation (FT) line and produce an output file in python script. FT line is the on in a general uniprot flat file describing the nature of the proteins. Script written to this must produce an output file with the information in this line.
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评论(1)
我建议查看biopython:http://biopython.org
特别是他们的SeqIO模块:http://biopython.org/wiki/SeqIO
I suggest looking at biopython: http://biopython.org
In particular, their SeqIO module: http://biopython.org/wiki/SeqIO