如何在R中绘制数据框的所有列

Question

数据框有 n 列，我想得到 n 个图，每列一个图。

我是新手，对 R 不太熟悉，无论如何我找到了两个解决方案。

第一个可以工作，但它不打印列名称（我需要它们！）：

data <- read.csv("sample.csv",header=T,sep=",")
for ( c in data ) plot( c, type="l" )

第二个工作更好，因为它打印列名称：

data <- read.csv("sample.csv",header=T,sep=",")
for ( i in seq(1,length( data ),1) ) plot(data[,i],ylab=names(data[i]),type="l")

有没有更好的（从 R 语言的角度来看）解决方案？

Answer 1

ggplot2 包需要一点点学习，但结果看起来非常好，您可以获得漂亮的图例，以及许多其他不错的功能，所有这些都无需编写太多代码。

require(ggplot2)
require(reshape2)
df <- data.frame(time = 1:10,
                 a = cumsum(rnorm(10)),
                 b = cumsum(rnorm(10)),
                 c = cumsum(rnorm(10)))
df <- melt(df ,  id.vars = 'time', variable.name = 'series')

# plot on same grid, each series colored differently -- 
# good if the series have same scale
ggplot(df, aes(time,value)) + geom_line(aes(colour = series))

# or plot on different plots
ggplot(df, aes(time,value)) + geom_line() + facet_grid(series ~ .)

Answer 2

有一种非常简单的方法可以使用单独的面板或同一面板绘制数据框中的所有列：

plot.ts(data)

产生结果（其中 X1 - X4 是列名称）：

查看 ?plot.ts 了解所有选项。

如果您不想更多地控制绘图函数并且不使用循环，您也可以执行以下操作：

par(mfcol = c(ncol(data), 1))
Map(function(x,y) plot(x, main =y), data, names(data))

Answer 3

您可以跳过重重困难，将您的解决方案转换为 lapply、sapply 或 apply 调用。 （我看到@jonw展示了一种方法来做到这一点。）除此之外，您已经拥有的是完全可以接受的代码。

如果这些都是时间序列或类似的时间序列，那么以下可能是一个合适的替代方案，它将每个序列绘制在单个绘图区域的其自己的面板中。我们使用zoo包，因为它确实可以很好地处理这样的有序数据。

require(zoo)
set.seed(1)
## example data
dat <- data.frame(X = cumsum(rnorm(100)), Y = cumsum(rnorm(100)),
                  Z = cumsum(rnorm(100)))
## convert to multivariate zoo object
datz <- zoo(dat)
## plot it
plot(datz)

这给出：

Answer 4

我很惊讶没有人提到matplot。如果您不需要在单独的轴上绘制每条线，这非常方便。
只需一个命令：

matplot(y = data, type = 'l', lty = 1)

使用 ?matplot 查看所有选项。

要添加图例，您可以设置调色板，然后添加它：

mypalette = rainbow(ncol(data))
matplot(y = data, type = 'l', lty = 1, col = mypalette)
legend(legend = colnames(data), x = "topright", y = "topright", lty = 1, lwd = 2, col = mypalette)

Answer 5

使用上面的一些技巧（特别感谢 @daroczig 的 names(df)[i] 形式），该函数会打印数值变量的直方图和因子变量的条形图。探索数据框架的良好开端：

par(mfrow=c(3,3),mar=c(2,1,1,1)) #my example has 9 columns

dfplot <- function(data.frame)
{
  df <- data.frame
  ln <- length(names(data.frame))
  for(i in 1:ln){
    mname <- substitute(df[,i])
      if(is.factor(df[,i])){
        plot(df[,i],main=names(df)[i])}
        else{hist(df[,i],main=names(df)[i])}
  }
}

最良好的祝愿，Mat。

Answer 6

不幸的是，ggplot2 没有提供一种在不将数据转换为长格式的情况下（轻松地）执行此操作的方法。您可以尝试对抗它，但数据转换会更容易。这里是所有方法，包括来自 reshape2 的 melt、来自 tidyr 的 gather 和来自 tidyr 的 pivot_longer：将 data.frame 从宽格式重塑为长格式

这是一个使用 pivot_longer：

> df <- data.frame(time = 1:5, a = 1:5, b = 3:7)
> df
  time a b
1    1 1 3
2    2 2 4
3    3 3 5
4    4 4 6
5    5 5 7

> df_long <- df %>% pivot_longer(c(a, b), names_to = "colname", values_to = "val")
> df_long
# A tibble: 10 x 3
    time colname   val
   <int> <chr>   <int>
 1     1 a           1
 2     1 b           3
 3     2 a           2
 4     2 b           4
 5     3 a           3
 6     3 b           5
 7     4 a           4
 8     4 b           6
 9     5 a           5
10     5 b           7

如您所见，pivot_longer 放置选定的列names_to 指定的任何内容（默认“name”），并将长值放入 values_to 指定的任何内容（默认“value”）。如果我同意默认名称，我可以使用 df %>%ivot_longer(c("a", "b"))。

现在您可以正常绘图：

ggplot(df_long, aes(x = time, y = val, color = colname)) + geom_line()

Answer 7

对于格子：

library(lattice)

df <- data.frame(time = 1:10,
                 a = cumsum(rnorm(10)),
                 b = cumsum(rnorm(10)),
                 c = cumsum(rnorm(10)))

form <- as.formula(paste(paste(names(df)[- 1],  collapse = ' + '),  
                         'time',  sep = '~'))

xyplot(form,  data = df,  type = 'b',  outer = TRUE)

Answer 8

您可以使用 main 选项指定标题（以及通过 xlab 和 ylab 指定轴的标题）。例如：

plot(data[,i], main=names(data)[i])

如果您想绘制（并保存）数据帧的每个变量，您应该使用 png、pdf 或您需要的任何其他图形驱动程序，然后在该问题之后一个 dev.off() 命令。例如：

data <- read.csv("sample.csv",header=T,sep=",")
for (i in 1:length(data)) {
    pdf(paste('fileprefix_', names(data)[i], '.pdf', sep='')
    plot(data[,i], ylab=names(data[i]), type="l")
    dev.off()
}

或者使用 par() 的 mfrow 参数将所有绘图绘制到同一图像。例如：使用 par(mfrow=c(2,2) 将接下来的 4 个图包含在同一“图像”中。

Answer 9

我这台计算机上没有 R，但这里有一个破解方法。您可以使用 par 在一个窗口中显示多个绘图，或者像这样在显示下一页之前提示单击。

plotfun <- function(col) 
  plot(data[ , col], ylab = names(data[col]), type = "l")
par(ask = TRUE)
sapply(seq(1, length(data), 1), plotfun)

Answer 10

如果 .csv 文件中的列名称不是有效的 R 名称：

data <- read.csv("sample.csv",sep=";",head=TRUE)
data2 <- read.csv("sample.csv",sep=";",head=FALSE,nrows=1)

for ( i in seq(1,length( data ),1) ) plot(data[,i],ylab=data2[1,i],type="l")

Answer 11

此链接对同样的问题帮助了我很多：

p = ggplot() + 
  geom_line(data = df_plot, aes(x = idx, y = col1), color = "blue") +
  geom_line(data = df_plot, aes(x = idx, y = col2), color = "red") 

print(p)

https://rpubs.com/euclid/343644