Scipy 稀疏矩阵中的寻址范围

发布于 2024-10-15 08:46:18 字数 588 浏览 2 评论 0原文

我有一个大矩阵,目前在 numpy 中,我想将其移植到 scipy 稀疏矩阵,因为保存 numpy (2000,2000) 矩阵的文本表示超过 100mb。

(1) scipy 中似乎有太多可用的稀疏矩阵 [例如, lil_matrixdok_matrix< /a>- 哪一个对于简单递增来说是最佳的,并且可以有效地保存到数据库?

(2) 我希望能够像这样解决矩阵中的范围:

>> import numpy as np    
>> a = np.zeros((1000,1000))
>> a[3:5,4:7] += 1

似乎这对于稀疏矩阵来说是不可能的?

I have a large matrix, currently in numpy that i would like to port over to scipy sparse matrix, because saving the text representations of the numpy (2000,2000) matrix is over 100mb.

(1) There seem to a surfeit of sparse matrices available in scipy [for instance, lil_matrix or dok_matrix- which one would be optimal for simple incrementing, and efficient to save to a database?

(2)
I'd like to be able to address ranges in the matrix like so:

>> import numpy as np    
>> a = np.zeros((1000,1000))
>> a[3:5,4:7] += 1

It seems that this is not possible for the sparse matrices?

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评论(1

陪我终i 2024-10-22 08:46:18

我不能说哪个存储效率最高。这将取决于您的数据。

不过,我可以说 += 运算符是有效的,只是您不能依赖通常的数组广播规则:

>>> m = sparse.lil_matrix((100,100))
>>> m[50:56,50:56]+=scipy.ones((6,6))
>>> m[50,50]  #1.0

I can't say which is most efficient to store. It's going to depend on your data.

I can say, however that the += operator works, just that you can't rely on the usual array broadcasting rules:

>>> m = sparse.lil_matrix((100,100))
>>> m[50:56,50:56]+=scipy.ones((6,6))
>>> m[50,50]  #1.0
~没有更多了~
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