将 RMySQL 包添加到 R 失败（在 Windows 上）？

Question

我不明白为什么我的 RMySQL 包无法安装 - 这就是我得到的结果：

> install.packages('RMySQL',type='source')
trying URL 'http://cran.mirrors.hoobly.com/src/contrib/RMySQL_0.7-5.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 160769 bytes (157 Kb)
opened URL
downloaded 157 Kb

* installing *source* package 'RMySQL' ...
ERROR: configuration failed for package 'RMySQL'
* removing 'C:/PROGRA~1/R/R-212~1.0/library/RMySQL'

The downloaded packages are in '(foo)'

Warning message:
In install.packages("RMySQL", type = "source") : installation of package 'RMySQL' had    non-zero exit status

我不认为这是 MySQL 安装的问题，因为正确的值似乎在注册表中：

> Sys.getenv('MYSQL_HOME')
                 MYSQL_HOME "C:/PROGRA~1/MySQL/MYSQLS~1.1/" 
> readRegistry("SOFTWARE\\MySQL AB", hive="HLM", maxdepth=2)
$`MySQL Server 5.1`
$`MySQL Server 5.1`$DataLocation
[1] "C:\\Documents and Settings\\All Users\\Application Data\\MySQL\\MySQL Server 5.1\\"

$`MySQL Server 5.1`$FoundExistingDataDir 
[1] "0"

$`MySQL Server 5.1`$Location 
[1] "C:\\Program Files\\MySQL\\MySQL Server 5.1\\"

$`MySQL Server 5.1`$Version
[1] "5.1.54"

困惑。任何帮助将不胜感激！

Answer 1

基本过程在这里进行了描述，但是有几个提示，所以我会描述整个解决方案（请根据需要更改 R 版本和路径）：

1. 从 此处
2. 安装MySQL或mysql的头文件和库文件
3. 创建或编辑文件C:\Program Files\R\R-2.12.1\etc\Renviron.site 并添加类似 MYSQL_HOME=C:/mysql (mysql 文件的路径) 的行，
4. 将 libmysql.lib 从 mysql/lib 复制到 mysql/lib/opt 以满足依赖关系。
5. 将 libmysql.dll 复制到 C:\Program Files\R\R-2.12.1\bin 或 windows/system32 目录。
6. 运行 install.packages('RMySQL',type='source') 并等待编译结束。

这对我在 Windows 7 64 位上有效，因此 32 位版本应该没有问题

最初发布 这里（类似问题）。

Answer 2

首先，我会尝试按照此页面上的说明进行操作：http://biostat.mc.vanderbilt。 edu/wiki/Main/RMySQL

然后，确保您的计算机上确实有 MySQL 客户端，而不仅仅是服务器本身。我自己也遇到过一个问题，我必须为客户端使用旧的二进制文件，但是您可以从 mysql 网站下载这些文件。

Answer 3

我创建了一个可能对人们有用的二进制文件：

http:// /kenahoo.blogspot.com/2011/09/rmysql-binary-for-windows-7.html

我基本上遵循了所有这些指示，包括范德比尔特页面上的指示，但由于某种原因它没有”似乎总是有效。无论如何，希望这对拥有与我使用的相同版本的东西的人有所帮助。

Answer 4

我在使用 R 2.12.1 x64 的 Windows 7 上遇到了同样的问题，并通过以下方法解决了该问题：

1. 将我的 PATH 变量中的 R 目录更改为 C:\Program Files\R\R-2.12 .1\bin\x64（而不仅仅是...\R-2.12.1\bin）。
2. 正在将 ...\MySQL Server 5.5\lib\libmysql.dll 复制到 ...\MySQL Server 5.5\bin\。
3. 在cmd.exe中运行R CMD INSTALL RMySQL_0.7-5.tar.gz（在R中install.packages('RMySQL',type='source')仍然会不工作）。

Answer 5

我遇到了这个在 Windows7 64 位下安装 RMySQL 的分步指南。

http://www.ahschulz.de/2013/07/ 23/installing-rmysql-under-windows/

我使用的软件是：

1. Windows 8 OS
2. R3.0.2 - 64bit
3. Rtools 3.1
4. MySQL Server Community Edition 5.6 - 64bit

按照上面的指南（提供截图），我的安装和RMySQL 包的加载工作正常。

非常感谢阿恩·亨德里克·舒尔茨！

Answer 6

正如马雷克所说。该软件包没有 Windows 二进制文件。当我尝试安装 RPostgreSQL 时，我在 Mac 上也遇到了类似的问题（因为没有适用于 Mac 的二进制文件），最后我不得不自己编译它并修改几个文件。

对于 MySQL 部分（如果您对 MySQL 不太了解），您可能需要使用 WAMP诚然，这超出了您的需要，但易于安装、启动和关闭。

对于一些编译帮助，您可能会对 Rtools 感兴趣

HTH

顺便说一句：您运行什么类型的窗口（抱歉，如果我错过了）

Answer 7

不过，目前还有一项附加要求（MySQL 服务器版本 5.5 和 R2.12.1）请遵循 http://biostat.mc.vanderbilt.edu/wiki/Main/RMySQL 说明作为 libmySQL 的位置。 dll 与包中预期的不同。

即64位编译。
它期望 libmySQL.dll 位于“${MYSQL_HOME}”/bin/libmySQL.dll 中
因此，只需将 dll 复制到 /bin 目录即可编译。

用于32位编译。
libmySQL.lib 预计位于“${MYSQL_HOME}”/lib/opt/libmysql.lib 中
再次移动这应该可以解决问题。

或者，如果您不想或无法移动这些文件。然后您可以编辑源代码文件：
Makevars.win
Makevars.win32
Makevars.win64
适当地指向 /lib/libmysql.dll /lib/libmysql.lib

Answer 8

将 MySQL 和 RTools 目录添加到 PATH！

这是我的路径 ; ~blah~;C:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.5\bin;c:\rtools\bin;C:\Rtools\gcc-4.6.3\bin;

Answer 9

我花了两天时间使用 RMySQL 软件包安装 R，终于找到了解决方案，以下是安装 RMySQL 软件包的步骤：-

1. 从以下链接下载软件：
   *一个。 R2.13.2：从 http://cran.stat.sfu.ca/index.html< 下载 R /a>

   <前><代码> b． RTools 214：从 http://cran.cict.fr 下载 RTools

   c. RMySQL 0.8-0.tar.gz：从以下位置下载 RMySQL
   http://biostat.mc.vanderbilt.edu/wiki/main/RMySQL/RMySQL_0.8-0.tar.gz

   d. MySQL Server 5.0：从http://dev.mysql.com下载

   e. RSTUDIO（可选）：从 http://rstudio.org* 下载
   

2. 设置以下环境变量

   <前><代码> * a. MYSQL_HOME :/MySQL 安装文件夹的路径
   例如 MYSQL_HOME= C:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.5\

   b. R_HOME：<驱动器>/R 安装路径
   例如 R_HOME=C:\Program Files\R\R-2.13.2\

   c. PATH：修改路径以容纳上述变量。 *

   确保以下路径包含在您的 Windows PATH 变量中：
   \Rtools\2.14\bin
   \Rtools\2.14\MinGW\bin
   \Rtools\2.14\MinGW64\bin

3. 创建文件夹并复制文件

   a. OPT：在C:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.5\lib下创建文件夹OPT并复制
   MYSQLLIB.LIB 上面的路径。还将 libmysql.dll 复制到 \\R\R-2.14.0\bin\ （64 位）或 \\R\R-2.14.0\bin\i386\ （32 位）和 C:\Windows\System32。

b. Renviron.site：创建或编辑文件 \\R\R-2.14.0\etc\Renviron.site 并添加
行：MYSQL_HOME =”C:/Program Files/MySQL/MySQL Server 5.5/”
注意：此处使用正斜杠和双引号

c． libMySQL.dll：将此文件复制到 C:\Program Files\R\R-2.13.2\bin\i386 以及 C:\Program
文件\R\R-2.13.2\bin

1. 运行命令

   a. Install.Packages：通过单击桌面上的 R 图标或从“开始”菜单运行 R GUI。类型
   INSTALL.PACKAGES(“RMySQL”，类型=“源”)。这将从存储库下载所需的软件。

b.命令提示符：复制下载的 zip 文件（在步骤 4.a 中）并将其粘贴到 R 下
安装文件夹。转到开始菜单并打开命令提示符。转到 R 安装文件夹并输入 R CMD INSTALL RMySQL_0.8-0.tar.gz

  *COMMANDS:
  >library(RMySQL)
   >drv = dbDriver("MySQL")
   >con = dbConnect(drv,host="localhost",dbname="test",user="root",pass="root")
   >album = dbGetQuery(con,statement="select * from t_master")
   >album*

Answer 10

18 个月后，新笔记本电脑，同样的问题。回到犯罪现场——对不起2011年1月的自己；我们身处未来，但这个装置仍然没有任何乐趣。

经验教训：

- 更新的 RTools 是必不可少的。获取它们。

- 您是否看到类似 .onLoad failed in loadNamespace() for 'RMySQL', details 的错误？这似乎意味着您的系统环境变量有问题。

在 R 中，运行

Sys.getenv('MYSQL_HOME')

如果它返回一条路径，就像

 [1] "C:\\Program Files\\MySQL\\MySQL Server 5.6"

你很好一样。但如果它给你空字符串，你需要设置它。

这些都是 Windows 7 的说明，但如果没记错的话，XP 中的过程非常相似。

1) 调出系统属性>高级>环境变量。

2) 在下方的“系统变量”窗格中，单击“新建”。

3）变量名称是MYSQL_HOME，值是MySQL安装的路径 - 我的是C:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.6

较新版本的MySQL不适用似乎没有在安装时创建环境变量 - 这以及 RMySQL 二进制文件的缺乏解释了为什么这个问题获得了 8,000 次点击。

-还卡住了吗？这里有另外两篇深入的文章：1、2

Answer 11

以下在 Red Hat Linux 中为我工作

wget http://cran.r-project.org/src/contrib/RMySQL_0.9-3.tar.gz
sudo R CMD INSTALL  --configure-args='--with-mysql-inc=/usr/include/mysql' --configure-args='--with-mysql-lib=/usr/lib64/mysql' RMySQL_0.9-3.tar.gz