验证 DICOM 文件

Question

我必须从文件夹中选择所有有效的 DICOM 文件。我可以递归地从具有 *.DCM 扩展名的文件夹中选取所有文件。但任何带有 *.DCM 的文件也会被拾取，并且此类文件不是有效的 DICOM 文件。

什么是最好的方法。

我想读取文件的几个字节并进行验证。

或者

任何其他方法或我们拥有的任何其他可验证的 EXE。

谢谢你， Harsha

编辑：问题的解决方案： 我最终使用了dcmftest.exe进行验证。希望我走在正确的轨道上。 -哈沙

Answer 1

您想要识别 DICOM 文件，而不是验证。有很大的区别。验证意味着（至少！）其 SOP 类所需的所有标签都存在。

识别很容易，因为 DICOM 文件必须在偏移量 0x80 处包含文本 DICM，因此标签从文件的偏移量 0x84 开始。

请注意，有时仅存储序列化数据集（从文件偏移量 0 处的标签组 8 开始），这些更难以识别，但不是标准的。

编辑：作为示例，请考虑 RAR 存档。它很容易识别，因为它以 Rar! 开头。然而，为了确保它是有效的 RAR 存档，您必须解压缩所有文件并检查它们的 CRC，而这只能由 RAR 本身完成（而且速度很慢）。

Answer 2

我知道这个问题已经得到解答，但我有类似的要求，所以我想出了一些扩展方法来做到这一点。适用于文件、文件流、内存流和通用流。仅读取验证文件类型所需的特定 4 个字节。非常高效，我能够在几秒钟内运行完数千个文件。

C#

public static class Dicom
{
    public static bool IsDicomFile(this Stream s)
    {
        //Create an empty 4 byte array
        byte[] dba = new byte[4];

        //Seek to 0x80
        s.Seek(128, SeekOrigin.Begin);

        //Read the following 4 dba
        s.Read(dba, 0, 4);

        //Compare to 'DICM'
        return dba.SequenceEqual(new byte[4] {68, 73, 67, 77});
    }

    public static bool IsDicomFile(this MemoryStream ms)
    {
        return ((Stream)ms).IsDicomFile();
    }

    public static bool IsDicomFile(this FileStream fs)
    {
        return ((Stream)fs).IsDicomFile();
    }

    public static bool IsDicomFile(this FileInfo fi)
    {
        return fi.OpenRead().IsDicomFile();
    }
}

VB.NET

<Extension()> _
Public Function IsDicomFile(ByVal s As Stream) As Boolean
    'Create an empty 4 byte array
    Dim dba() As Byte = New Byte(3) {}

    'Seek to 0x80
    s.Seek(128, SeekOrigin.Begin)

    'Read the subsequent 4 bytes
    s.Read(dba, 0, 4)

    'Compare to 'DICM'
    Return dba.SequenceEqual(New Byte(3) {68, 73, 67, 77})
End Function

<Extension()> _
Public Function IsDicomFile(ByVal ms As MemoryStream) As Boolean
    Return DirectCast(ms, Stream).IsDicomFile
End Function

<Extension()> _
Public Function IsDicomFile(ByVal fs As FileStream) As Boolean
    Return DirectCast(fs, Stream).IsDicomFile
End Function

<Extension()> _
Public Function IsDicomFile(ByVal fi As FileInfo) As Boolean
    Return fi.OpenRead().IsDicomFile
End Function

Answer 3

仅供参考，具有 .dcm 扩展名的文件并不是真正合法的 DICOM，尽管出于遗留原因，最好编写程序来接受它们（但您不应该在应用程序导出的 DICOM 文件上放置 3 个字符的文件扩展名）。根据 DICOM 标准中有关媒体交换的部分，“不得使用 ISO 9660 文件扩展名”。此外，除了标准第 10 部分和第 12 部分中描述的特殊 DICOMDIR 文件之外，不应从文件名或目录结构推断任何语义。

ruslik的答案为您提供了识别 DICOM 文件的正确方法。如果文件前导码中的指定位置有 DICM，则它是 DICOM 文件。否则就不是了。

Answer 4

For Java User
dcm4che-tool-dcmvalidate
usage: dcmvalidate --iod  [..][..]
Utility to validate DICOM objects according a specified Information Object
Definition.
-
Options:
 -h,--help             display this help and exit
    --iod    path to xml file with Information Object Definition
 -V,--version          output version information and exit
Example:
$ dcmvalidate --iod etc/dcmvalidate/dicomdir-iod.xml DICOMDIR

Validate DICOMDIR against IOD specified in etc/dcmvalidate/dicomdir.xml

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Answer 5

请注意：检查“DICM”前导码将仅检查文件是否为 DICOM v3 文件。

以前版本的 DICOM 没有序言。可以查看的 100% 有效 DICOM 文件，具有所有必要的 DICOM 标签等，并且可以导入到 DICOM 节点中，没有前导码。

我正在与 OFFIS 核实，看看 DCMCHECK 的许可版本是否也有此限制，但我还没有收到他们的回复。

Answer 6

考虑到不同 IOD 中存在不同的强制和可选标签，验证 DICOM 文件并不是一件容易的任务。我认为最好使用现有的解决方案来做到这一点。您可以查看来自 DCMTK 的 DCMCHECK 来执行此操作。