PubMed 文章的全文 PDF
在开展项目时，我需要下载和处理 PubMed 摘要的全文文章，是否有任何实现的代码或工具允许用户输入一组 PubMed id 并下载相同的免费全文文章。非常感谢任何类型的帮助或提示。
While working on a project I need to download and process full text articles for PubMed abstracts, is there any implemented code or tool that allows the user to input a set of PubMed ids and downloads the free full text articles for the same. Any kind of help or tips is greatly appreciated.
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评论（2）
由于 PubMed 的性质，我认为一般来说这是不可能的。您要做的最好的事情就是从 PubMedCentral 的开放获取子集获取文章。 PubMedCentral 有许多在线实用程序来完成这项工作。
I don't think it's possible in general, due to the nature of PubMed. The best you are going to do is get articles from the Open Access subset of PubMedCentral. PubMedCentral have a number of online utilities for doing the job.
StompChicken 指向的实用程序是供发布者在提交给 PMC 之前验证其 XML 的，它们不是用于下载的工具。
请注意，PMC 中的绝大多数文章都不是开放获取 (OA)，因此无法通过任何方式自动（合法）下载。 NCBI 警告：
要下载 PMC 内容，最好的方法是使用 PMC Open Access FTP 服务： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/tools/ftp/
您还可以使用 eutils 查询 PMC 并下载 OA 子集的全文以及其余部分的摘要： http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/corehtml /query/static/efetchlit_help.html
另一种选择是使用 OAI 服务：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/tools/oai/
OAI 服务的记录非常糟糕，但这里有一些入门提示：http://www.biostars.org/p/2076/#13338
如果您想维护和更新 PMC存储库，尝试 pubtools：http://code.google.com/p/pubtools/
The utilities StompChicken points to are for publishers to validate their XML before submission to PMC, they are not tools for downloading.
Note that the vast majority of articles in PMC are not open access (OA) and therefore cannot be downloaded automatically (legally) by any means. NCBI warns:
For downloading PMC content, the best way is to use the PMC Open Access FTP service: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/tools/ftp/
You can also use eutils to query the PMC and download full-text of the OA subset as well as abstracts of the remainder: http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/corehtml/query/static/efetchlit_help.html
Another alternative is to use the OAI service: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/tools/oai/
The OAI service is horribly documented, but some tips to get started are here: http://www.biostars.org/p/2076/#13338
If you want to maintain and update a PMC repository, try pubtools: http://code.google.com/p/pubtools/