如何使 sweave 将生成的图形复制到子文件夹中？

Question

我很想在从我的 Sweave 报告创建的所有graphics.pdf 上使用一些基于 shell 脚本的 pdfcrop。因此，如果所有图形都存储到一个子文件夹中，而不是放在所有乳胶内容（如 .aux .log 文件（等等）所在的位置），那就太好了。如果我只需对特定目录中的所有文件使用裁剪脚本，那就容易多了。

这是我的 Sweave 块：

\begin{figure}[htbp]
  \begin{center}
  <<fig=true,echo=false>>=
  print(mygraph)
  @
\caption{my graph}
\end{center}
\end{figure}

如果我运行 sweave 代码，mygraph.pdf 将存储在与 report.tex 文件本身相同的目录中。

有没有办法将此文件存储在现有的子文件夹中，例如 /graphics ？

Answer 1

将此：

\SweaveOpts{prefix.string=foo/bar}

插入到您的 Sweave 源文件中，最好位于序言的顶部。上面这行内容取自 Sweave FAQ，表示创建的图形将存储在（Sweave 源所在目录的）子目录 foo 中，每个图像文件名都以 栏。这个以及更多内容在 Sweave 常见问题解答。

Answer 2

好的 RTFM，ran2。

操作方法如下：

 \SweaveOpts{prefix.string=graphics/report} 

另请参阅：手册。

Graphics 是目录，report 是您可能想要使用的子字符串。至少你会在谷歌上找到更好的:)

编辑：

为了完整起见，我将在这里添加几行shell脚本：

#!/bin/sh
R CMD Sweave report.Rnw   
for file in `ls graphics`;
do pdfcrop "$file" graphics/"$file"
done
pdflatex report.tex
open report.pdf

也许你们中的一些人想使用 $1 作为目录参数。