将 numpy 数组转换为矩阵 rpy2、Kmeans

Question

我有一个 numpy 2D 数组 self.sub 我想在 rpy2 kmeans 中使用它。 k = robjects.r.kmeans(self.sub,2,20) 我总是收到以下错误： valueError：目前无法对该类型执行任何操作！ 我能做些什么？

Answer 1

从 rpy2 docs 来看，R 矩阵只是向量他们暗淡的属性集。因此，对于 numpy 二维数组 x ，

import rpy2.robjects as robj

nr, nc = x.shape
xvec = robj.FloatVector(x.transpose().reshape((x.size))
xr = robj.r.matrix(xvec, nrow=nr, ncol=nc)

您必须转置 numpy 数组，因为 R 按列填充矩阵。

编辑：实际上，您可以在 R 矩阵函数中设置 byrow=True ，然后就不需要转置了。