Java Webstart 应用程序的内存分配

Question

我正在使用名为 BLAST2GO 的 Java Webstart 应用程序，我遇到了内存分配问题。它需要将大型数据集加载到内存中，因此我一直尝试为该应用程序分配3-6GB。但是，无论我将最大堆大小设置为多少，它始终使用 455MB（如消息栏所示：“内存使用量：455MB 的 xxMB”）。我尝试将其设置为非常合理的级别（1024 MB），但仍然只分配了 455MB。

有什么想法吗？

顺便说一句，我使用的是 Ubuntu 10.04 32 位，24GB 内存，8 个进程。

更新：这是他们提供的 JNLP。当我编辑 initial-heap-size 和 max-heap-size 属性的值时，我得到相同的结果。

<jnlp spec="1.0+" codebase="http://bioinfo.cipf.es/blast2go/webstart" href="http://bioinfo.cipf.es/blast2go/webstart/makeJnlp.php?mem=3072">
<information>
<title>Blast2GO 3072M</title>
<vendor>CIPF - UPV - IVIA</vendor>
<homepage href="http://www.blast2go.org"/>
<description>Blast2GO 3072M</description>
<description kind="short">Blast2GO 3072M</description>
<icon href="splash.gif"/>
<offline-allowed/>
</information>
<security>
<all-permissions/>
</security>
<resources>
<j2se version="1.5+" initial-heap-size="64m" max-heap-size="3072M"/>
<jar href="ext/blast2go.jar"/>
<jar href="ext/biojava-1.3.1.jar"/>
<jar href="ext/jfreechart-1.0.10.jar"/>
<jar href="ext/mysql-connector-java-3.0.11-stable-bin.jar"/>
<jar href="ext/zvtm.jar"/>
<jar href="ext/jakarta-regexp-1.4.jar"/>
<jar href="ext/jcommon-1.0.13.jar"/>
<jar href="ext/Simpat1.1.jar"/>
<jar href="ext/iText-2.1.1.jar"/>
<jar href="ext/jdom/activation.jar"/>
<jar href="ext/jdom/ant.jar"/>
<jar href="ext/jdom/jaxen-core.jar"/>
<jar href="ext/jdom/jaxen-jdom.jar"/>
<jar href="ext/jdom/jdom.jar"/>
<jar href="ext/jdom/mail.jar"/>
<jar href="ext/jdom/saxpath.jar"/>
<jar href="ext/jdom/xalan.jar"/>
<jar href="ext/jdom/xerces.jar"/>
<jar href="ext/jdom/xml-apis.jar"/>
<jar href="ext/interpro/commons-cli-1.0.jar"/>
<jar href="ext/interpro/commons-cli.jar"/>
<jar href="ext/interpro/freefluo.jar"/>
<jar href="ext/interpro/servlet.jar"/>
<jar href="ext/interpro/WSInterProScan.jar"/>
<jar href="ext/axis_1_4/axis-ant.jar"/>
<jar href="ext/axis_1_4/axis.jar"/>
<jar href="ext/axis_1_4/commons-discovery-0.2.jar"/>
<jar href="ext/axis_1_4/commons-logging-1.0.4.jar"/>
<jar href="ext/axis_1_4/jaxrpc.jar"/>
<jar href="ext/axis_1_4/keggapi.jar"/>
<jar href="ext/axis_1_4/log4j-1.2.8.jar"/>
<jar href="ext/axis_1_4/saaj.jar"/>
<jar href="ext/axis_1_4/wsdl4j-1.5.1.jar"/>
<jar href="ext/axis2/activation-1.1.jar"/>
<jar href="ext/axis2/annogen-0.1.0.jar"/>
<jar href="ext/axis2/axiom-api-1.2.2.jar"/>
<jar href="ext/axis2/axiom-dom-1.2.2.jar"/>
<jar href="ext/axis2/axiom-impl-1.2.2.jar"/>
<jar href="ext/axis2/axis2-adb-1.1.1.jar"/>
<jar href="ext/axis2/axis2-adb-codegen-1.1.1.jar"/>
<jar href="ext/axis2/axis2-codegen-1.1.1.jar"/>
<jar href="ext/axis2/axis2-java2wsdl-1.1.1.jar"/>
<jar href="ext/axis2/axis2-jaxbri-1.1.1.jar"/>
<jar href="ext/axis2/axis2-jibx-1.1.1.jar"/>
<jar href="ext/axis2/axis2-kernel-1.1.1.jar"/>
<jar href="ext/axis2/axis2-saaj-1.1.1.jar"/>
<jar href="ext/axis2/axis2-soapmonitor-1.1.1.jar"/>
<jar href="ext/axis2/axis2-spring-1.1.1.jar"/>
<jar href="ext/axis2/axis2-tools-1.1.1.jar"/>
<jar href="ext/axis2/axis2-xmlbeans-1.1.1.jar"/>
<jar href="ext/axis2/backport-util-concurrent-2.2.jar"/>
<jar href="ext/axis2/commons-codec-1.3.jar"/>
<jar href="ext/axis2/commons-fileupload-1.1.1.jar"/>
<jar href="ext/axis2/commons-httpclient-3.0.1.jar"/>
<jar href="ext/axis2/commons-io-1.2.jar"/>
<jar href="ext/axis2/commons-logging-1.1.jar"/>
<jar href="ext/axis2/geronimo-spec-jms-1.1-rc4.jar"/>
<jar href="ext/axis2/jakarta-httpcore-4.0-alpha2.jar"/>
<jar href="ext/axis2/jaxb-api-2.0.2.jar"/>
<jar href="ext/axis2/jaxb-impl-2.0.2.jar"/>
<jar href="ext/axis2/jaxb-xjc-2.0.2.jar"/>
<jar href="ext/axis2/jaxen-1.1-beta-10.jar"/>
<jar href="ext/axis2/jibx-bind-1.1.3.jar"/>
<jar href="ext/axis2/jibx-run-1.1.3.jar"/>
<jar href="ext/axis2/mail-1.4.jar"/>
<jar href="ext/axis2/neethi-2.0.jar"/>
<jar href="ext/axis2/servletapi-2.3.jar"/>
<jar href="ext/axis2/stax-api-1.0.1.jar"/>
<jar href="ext/axis2/woden-1.0.0M6.jar"/>
<jar href="ext/axis2/wsdl4j-1.6.2.jar"/>
<jar href="ext/axis2/wstx-asl-3.2.0.jar"/>
<jar href="ext/axis2/xalan-2.7.0.jar"/>
<jar href="ext/axis2/xbean-2.2.0.jar"/>
<jar href="ext/axis2/xercesImpl-2.8.1.jar"/>
<jar href="ext/axis2/xml-apis-1.3.03.jar"/>
<jar href="ext/axis2/XmlSchema-1.2.jar"/>
<jar href="ext/batik/batik-anim.jar"/>
<jar href="ext/batik/batik-awt-util.jar"/>
<jar href="ext/batik/batik-bridge.jar"/>
<jar href="ext/batik/batik-codec.jar"/>
<jar href="ext/batik/batik-css.jar"/>
<jar href="ext/batik/batik-dom.jar"/>
<jar href="ext/batik/batik-extension.jar"/>
<jar href="ext/batik/batik-ext.jar"/>
<jar href="ext/batik/batik-gui-util.jar"/>
<jar href="ext/batik/batik-gvt.jar"/>
<jar href="ext/batik/batik-parser.jar"/>
<jar href="ext/batik/batik-script.jar"/>
<jar href="ext/batik/batik-svg-dom.jar"/>
<jar href="ext/batik/batik-svggen.jar"/>
<jar href="ext/batik/batik-swing.jar"/>
<jar href="ext/batik/batik-transcoder.jar"/>
<jar href="ext/batik/batik-util.jar"/>
<jar href="ext/batik/batik-xml.jar"/>
<jar href="ext/batik/js.jar"/>
<jar href="ext/batik/pdf-transcoder.jar"/>
<jar href="ext/batik/xalan-2.6.0.jar"/>
<jar href="ext/batik/xerces_2_5_0.jar"/>
<jar href="ext/batik/xml-apis-ext.jar"/>
<jar href="ext/batik/xml-apis.jar"/>
</resources>
<application-desc main-class="es.blast2go.prog.MainProg"/>
</jnlp>

更新：我尝试更改根 jnlp 标记中的 href 属性，但在终端上收到一条非常奇怪的消息。我想知道 Java 是否每次都会从该 URL 重新下载 JNLP，并忽略我编辑 JNLP 的尝试。有什么办法可以防止这种情况发生吗？

> javaws blast2go3GB.jnlp 
Error occurred during initialization of VM
CCoouulldd  nnoott  crreesaetrev et heen oJuagvha  svpiarcteu aflo rm aocbhjiencet. 
heap

最终更新：事实证明这是 Java 版本的问题。当我下载并使用 Sun Java 时，我得到了预期的行为。

Answer 1

您可以在 j2se 标记中指定堆大小，如下所示：

    <resources>
    .........
            <j2se version="1.6.0+" href="" initial-heap-size="1024m" max-heap-size="3000m" />
            <j2se version="1.5.0_05" href="" initial-heap-size="1024m" max-heap-size="3000m" />
            <j2se version="1.4.2_04" href="" initial-heap-size="1024m" max-heap-size="3000m" />        
    .........
    </resources>

并指定您将使用的每个 jre 版本。

Answer 2

如果您运行的是 32 位 Linux，则只能运行 32 位 JVM，每个实例的内存限制约为 4 Gb。我相信即使你对内核有更多的可见性也是如此。

如果您确实需要在单个 JVM 中使用大量内存，则需要使用 64 位。

---

编辑：Java WebStart 没有为 OpenJDK 开源，因此使用了替代实现。尝试下载并使用 Sun Java 来实现此目的。下载并解压 JDK，然后运行 ​​bin/javaws foo.jnlp 就足够了。

Answer 3

尝试使用手动命令行参数来设置它。像这样的东西：

Answer 4

您可以通过命令行选项简单地更改它，例如

javaws -J-Xmx16384m -J-Xms16384m <jnlp url>

Answer 5

您是否尝试过 blast2go 起始页 中的解决方案？

“Blast2GO 需要更多内存？使用动态内存 JNLP URL：”

http://bioinfo.cipf.es/blast2go/webstart/makeJnlp.php?mem=<put here the amount of memory you need>

目前尚不清楚这里发生了什么，但我认为blast2go 很可能正在执行一些手动内存管理技巧。 （它声称报告使用了多少内存这一事实就表明了这一点。）如果是这种情况，那么在调整 JNLP 文件时可能需要设置应用程序特定的参数或属性。

Answer 6

在生产中，如果客户希望根据可用的系统配置（客户端计算机上的 RAM 大小）自定义 jnlp 中的 java 堆大小

APPLICATION_TEMPLATE.JNLP 中的更改：使用 * 接受可配置值

appliation.jnlp 中的更改：

将实际值传递给 intial-heap-size 和 max-heap-size。
jnlp 文件支持 scriptlet 和表达式。

• 使用 scriptlet <% %>读取属性文件中的配置值
• 传递 <%=>;将实际值指向 intial-heap-size 的表达式和
  最大堆大小