R 中的参数、绘图、输出和最佳拟合线

Question

我在处理 R 中的一些数据时有几个问题：

1. 我正在使用以下语句：detailsTable <- read.table(file=commandArgs()[6], header=TRUE, col.names=c(" a", "b", "c", "d", "e")) 似乎该表没有正确加载...但是如果我明确指定要加载的文件的路径，那么一切都会进行出色地。我做错了什么？

2. 我绘制了上述表格中包含的数据。如何将绘图（例如：plot.savePDF("plot.pdf")）保存到 PDF 文件？

3. 如何将 cor(detailsTable$a,detailsTable$b) 的输出重定向到文件？以及如何将一个简单的字符串写入文件。例如：“数据的相关性：” + cor(...)

4. 如何在现有图上绘制最佳拟合线？

所有这些都在 R 中。

非常感谢任何可以提供帮助的人，

ExtremeCoder

Answer 1

我绘制了上述表格中包含的数据。如何将绘图（例如：plot.savePDF("plot.pdf")）保存到 PDF 文件？

 pdf("filename.pdf")
 plot(...)
 dev.off()

如何将 cor(detailsTable$a,detailsTable$b) 的输出重定向到文件？以及如何将一个简单的字符串写入文件。例如：“数据相关性：” + cor(...)

检查 write.table 手册页 (?write.table)

如何在现有绘图上绘制最佳拟合线？

x <- 1:10
y <- 2 * x + runif(10) 
plot (x, y, pch=20)
fit <- glm(y~x)
coefs <- coef(fit)
abline(coefs, lwd=2, col='red')
# Or also, without finding the coefficients
abline(fit, lwd=2, col='red')

Answer 2

您可以使用sink()重定向输出。

Answer 3

如何保存您正在生成的绘图取决于您使用的绘图系统。假设它是基本图形，您需要启动 pdf 图形设备，然后绘制到它。

pdf(file = "path/file.pdf", width = 5, height = 5)
...
#plotting commands here
...
dev.off()