使用cursor.copy_from() 的psycopg2 COPY 在大输入时冻结

发布于 2024-09-14 04:19:26 字数 574 浏览 7 评论 0原文

考虑以下 Python 代码，使用 psycopg2 cursor 对象（为了清楚起见，更改或省略了一些列名称）：

filename='data.csv'
file_columns=('id', 'node_id', 'segment_id', 'elevated', 
              'approximation', 'the_geom', 'azimuth')
self._cur.copy_from(file=open(filename),
                    table=self.new_table_name, columns=file_columns)

数据库位于快速 LAN 上的远程计算机上。
使用 bash 中的 \COPY 工作速度非常快，即使对于大型（~1,000,000 行）文件也是如此。

该代码对于 5,000 行来说速度非常快，但是当 data.csv 增长超过 10,000 行时，程序会完全冻结。

有什么想法\解决方案吗？

亚当

原文

Consider the following code in Python, using psycopg2 cursor object (Some column names were changed or omitted for clarity):

filename='data.csv'
file_columns=('id', 'node_id', 'segment_id', 'elevated', 
              'approximation', 'the_geom', 'azimuth')
self._cur.copy_from(file=open(filename),
                    table=self.new_table_name, columns=file_columns)

The database is located on a remote machine on a fast LAN.
Using \COPY from bash works very fast, even for large (~1,000,000 lines) files.

This code is ultra-fast for 5,000 lines, but when data.csv grows beyond 10,000 lines, the program freezes completely.

Any thoughts \ solutions?

Adam

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别低头，皇冠会掉 2024-09-21 04:19:26

这只是一种解决方法，但您可以将某些内容通过管道传输到 psql 中。有时，当我懒得摆脱 psycopg2 时，我会使用这个食谱

import subprocess
def psql_copy_from(filename, tablename, columns = None):
    """Warning, this does not properly quote things"""
    coltxt = ' (%s)' % ', '.join(columns) if columns else ''
    with open(filename) as f:
        subprocess.check_call([
            'psql',
            '-c', 'COPY %s%s FROM STDIN' % (tablename, coltxt),
            '--set=ON_ERROR_STOP=true', # to be safe
            # add your connection args here
        ], stdin=f)

就你的锁定而言，你是否使用多线程或类似的东西？

你的 postgres 是否记录了诸如关闭连接或死锁之类的信息？锁定后您能看到磁盘活动吗？

This is just a workaround, but you can just pipe something into psql. I use this recipe sometimes when I am too lazy to bust out psycopg2

import subprocess
def psql_copy_from(filename, tablename, columns = None):
    """Warning, this does not properly quote things"""
    coltxt = ' (%s)' % ', '.join(columns) if columns else ''
    with open(filename) as f:
        subprocess.check_call([
            'psql',
            '-c', 'COPY %s%s FROM STDIN' % (tablename, coltxt),
            '--set=ON_ERROR_STOP=true', # to be safe
            # add your connection args here
        ], stdin=f)

As far as your locking up is concerned, are you using multiple threads or anything like that?

Is your postgres logging anything such as a closed connection or a deadlock? Can you see disk activity after it locks up?

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