sweave 和 ggplot2：根本没有生成 pdf

Question

我正在尝试创建一个 sweave 报告，其中包含一些使用 ggplot2 完成的图形。虽然我正在寻找一些长期运行的环境 - 我只是在这里使用一个简单的 .Rnw 文件，其中仅包含代码和绘图

 \documentclass[a4paper]{article}
 \SweaveOpts{echo=FALSE}
 \usepackage{a4wide}

  \begin{document}

  \begin{figure}[htbp]
  \begin{center}
 <<>>=
 library(ggplot2)
 x=rnorm(100)
 qplot(x)

 @
 \caption{My Graph}
 \end{center}
  \end{figure}
\end{document}

不幸的是，图表没有创建，我只得到了损坏的 .pdf 和 .eps 文件。尽管我得到了一个不错的 .tex 文件，除了图形之外，它似乎可以工作。 我使用以下基本代码来创建它：

 Sweave("myfile.Rnw")

我刚刚在网络上发现了一些较旧的帖子，这些帖子正在讨论透明度和 sweave / ggplot2 的问题，但没有任何帮助。我也尝试过放松套餐，但也没有帮助。顺便问一下，decumar 包有什么消息吗？

Answer 1

qplot() 生成对象，而不是图形输出。当你运行它时，它看起来似乎是这样，但那是因为如果没有赋值，R 就会自动打印 qplot() 的输出。要将其集成到 Sweave 中，请将 print() 包裹在 qplot() 周围，或者将 qplot() 的输出分配给某些内容，然后包裹在 print() 中。

...
<<fig = T, echo = F>>=
 library(ggplot2)
 x=rnorm(100)
 p <- qplot(x)
 print(p)
@
...

那应该有效。我一直在我的 sweave 文档中使用 ggplot2 图形。

Answer 2

您必须将其包裹在 print() 周围才能使其在 sweave 中工作。

Answer 3

实际上，虽然前面的两个答案都是正确的，但你的问题是另外一回事。

您需要确保整个代码块位于页面的左侧（函数中的缩进除外）。同样，我不知道为什么，但这会给 Sweave 带来问题。

确保所有代码（以及代码块的页眉/页脚）位于页面左侧（并添加打印语句）后，您的示例对我有用。

顺便说一句，我今天了解到，您可以在 sweave 文档中围绕代码创建一个环境（我不知道，这会节省我很多时间）。很好的旧版 stackoverflow，即使在你回答问题的时候也会教你一些新东西！

希望这有帮助。