R：捕获“nls”中的错误

发布于 2024-09-03 14:54:20 字数 659 浏览 9 评论 0原文

我正在使用 nls 拟合一些指数数据。

我使用的代码是：

fit <- nls(y ~ expFit(times, A, tau, C), start = c(A=100, tau=-3, C=0))

expFit 定义为

expFit <- function(t, A, tau, C)
    {
    expFit <- A*(exp(-t/tau))+C
    }

这对于我的大多数数据来说效果很好，提供的起始参数（100、-3 和 0）效果很好。但有时，我的数据与这些参数不太相符，并且我会从 nls 中收到错误（例如“奇异梯度”或类似的东西）。我如何“捕获”这些错误？

我尝试做类似的事情

fit <- NULL
fit <- nls(...)

if (is.null(fit))
    {
    // Try nls with other starting parameters
    }

但这不起作用，因为 nls 似乎停止执行，并且 nls 之后的代码将不会执行...

有什么想法吗？

谢谢尼科

原文

I'm fitting some exponential data using nls.

The code I'm using is:

fit <- nls(y ~ expFit(times, A, tau, C), start = c(A=100, tau=-3, C=0))

expFit is defined as

expFit <- function(t, A, tau, C)
    {
    expFit <- A*(exp(-t/tau))+C
    }

This works well for most of my data, for which the starting parameters provided (100, -3 and 0) work well. Sometimes, though, I have data that doesn't go well with those parameters and I get errors from nls (e.g. "singular gradient" or things like that). How do I "catch" these errors?

I tried to do something like

fit <- NULL
fit <- nls(...)

if (is.null(fit))
    {
    // Try nls with other starting parameters
    }

But this won't work because nls seems to stop the execution and the code after nls will not execute...

Any ideas?

Thanks
nico

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野稚 2024-09-10 14:54:20

我通常使用这个技巧：

params<-... # setup default params.

while(TRUE){

fit<-NULL
try(fit<-nls(...)); # does not stop in the case of error

if(!is.null(fit))break; # if nls works, then quit from the loop

params<-... # change the params for nls

}

I usually use this trick:

params<-... # setup default params.

while(TRUE){

fit<-NULL
try(fit<-nls(...)); # does not stop in the case of error

if(!is.null(fit))break; # if nls works, then quit from the loop

params<-... # change the params for nls

}

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