当 DISPLAY 未定义时使用 matplotlib 生成 PNG

Question

我正在尝试将 networkx 与 Python 一起使用。当我运行该程序时，出现此错误。有什么遗漏吗？

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")


Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 13, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

---

我现在得到一个不同的错误：

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

matplotlib.use('Agg')

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")

---

/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/__init__.py:835: UserWarning:  This call to matplotlib.use() has no effect
because the the backend has already been chosen;
matplotlib.use() must be called *before* pylab, matplotlib.pyplot,
or matplotlib.backends is imported for the first time.

  if warn: warnings.warn(_use_error_msg)
Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 15, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/python2.5/site-packages/networkx-1.2.dev-py2.5.egg/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

---

我现在得到一个不同的错误：

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

matplotlib.use('Agg')

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")

---

/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/__init__.py:835: UserWarning:  This call to matplotlib.use() has no effect
because the the backend has already been chosen;
matplotlib.use() must be called *before* pylab, matplotlib.pyplot,
or matplotlib.backends is imported for the first time.

  if warn: warnings.warn(_use_error_msg)
Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 15, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/python2.5/site-packages/networkx-1.2.dev-py2.5.egg/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

Answer 1

主要问题是（在您的系统上）matplotlib 默认选择 x-using 后端。我刚刚在我的一台服务器上遇到了同样的问题。对我来说，解决方案是将以下代码添加到任何其他 pylab/matplotlib/pyplot 导入之前读取的位置：

import matplotlib
# Force matplotlib to not use any Xwindows backend.
matplotlib.use('Agg')

替代方法是 在您的 .matplotlibrc 中设置

Answer 2

只是作为 Reinout 答案的补充。

解决此类问题的永久方法是编辑 .matplotlibrc 文件。通过找到它

>>> import matplotlib
>>> matplotlib.matplotlib_fname()
# This is the file location in Ubuntu
'/etc/matplotlibrc'

然后将该文件中的后端修改为 backend : Agg。就是这样。

Answer 3

简单的答案是花一点时间正确准备您的执行环境。

准备执行环境的第一项技术是使用 Chris Q 明智推荐的 matplotlibrc 文件.，

backend : Agg

在该文件中进行设置。您甚至可以控制（无需更改代码）matplotlib 如何以及在何处查找和找到matplotlibrc 文件。

准备执行环境的第二种方法是使用 MPLBACKEND 环境变量（并通知您的用户使用它）：

export MPLBACKEND="agg"
python <program_using_matplotlib.py>

这很方便，因为您甚至不需要在磁盘上提供另一个文件来完成此工作。例如，我已采用这种方法进行持续集成测试以及在没有显示器的远程计算机上运行。

在 Python 代码中将 matplotlib 后端硬编码为“Agg”就像用大锤子将方钉敲入圆孔中一样，相反，您可以直接告诉 matplotlib 它需要是方孔。

Answer 4

我通过 Spark 使用 matplotlib 时遇到错误。 matplotlib.use('Agg') 对我不起作用。最后，以下代码对我有用。更多此处

import matplotlib.pyplot as plt.
plt.switch_backend('agg')

Answer 5

我将重复@Ivo Bosticky 所说的内容，但可以忽略不计。将这些行放在 py 文件的 VERY 开头。

import matplotlib
matplotlib.use('Agg') 

否则会出现错误

*/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/__init__.py:923: UserWarning:  This call to   matplotlib.use() has no effect
because the the backend has already been chosen;
matplotlib.use() must be called *before* pylab, matplotlib.pyplot,*

这将解决所有显示问题

Answer 6

我发现这个片段在 X 和 no-X 环境之间切换时效果很好。

import os
import matplotlib as mpl
if os.environ.get('DISPLAY','') == '':
    print('no display found. Using non-interactive Agg backend')
    mpl.use('Agg')
import matplotlib.pyplot as plt

Answer 7

登录服务器执行代码时
使用此代替：

ssh -X username@servername

-X 将消除无显示名称和无 $DISPLAY 环境变量
错误

：）

Answer 8

import matplotlib
matplotlib.use('Agg')
import matplotlib.pyplot as plt

这对我有用。

Answer 9

你用的是什么系统？看起来您的系统带有 X11，但 DISPLAY 环境变量未正确设置。尝试执行以下命令，然后重新运行您的程序：

export DISPLAY=localhost:0

Answer 10

另一件需要检查的事情是您当前的用户是否有权连接到 X 显示器。就我而言，root 不允许这样做，并且 matplotlib 抱怨同样的错误。

user@debian:~$ xauth list         
debian/unix:10  MIT-MAGIC-COOKIE-1  ae921efd0026c6fc9d62a8963acdcca0
root@debian:~# xauth add debian/unix:10  MIT-MAGIC-COOKIE-1 ae921efd0026c6fc9d62a8963acdcca0
root@debian:~# xterm

来源：http://www.debian-administration.org/articles/494 https://debian-administration.org/article/494/Getting_X11_forwarding_through_ssh_working_after_running_su< /a>

Answer 11

为了确保您的代码可以跨 Windows、Linux 和 OSX 以及有或没有显示器的系统移植，我建议使用以下代码片段：

import matplotlib
import os
# must be before importing matplotlib.pyplot or pylab!
if os.name == 'posix' and "DISPLAY" not in os.environ:
    matplotlib.use('Agg')

# now import other things from matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt

Credit: https ://stackoverflow.com/a/45756291/207661

Answer 12

对于 Google Cloud Machine Learning Engine：

import matplotlib as mpl
mpl.use('Agg')
from matplotlib.backends.backend_pdf import PdfPages

然后打印到文件：

#PDF build and save
    def multi_page(filename, figs=None, dpi=200):
        pp = PdfPages(filename)
        if figs is None:
            figs = [mpl.pyplot.figure(n) for n in mpl.pyplot.get_fignums()]
        for fig in figs:
            fig.savefig(pp, format='pdf', bbox_inches='tight', fig_size=(10, 8))
        pp.close()

并创建 PDF：

multi_page(report_name)

Answer 13

import matplotlib
matplotlib.use('Agg')

只要我直接调用绘图函数/代码，就对我有用。但是，如果您使用

from joblib import Parallel, delayed

并行和延迟模块来并行化代码，那么您需要

matplotlib.rcParams.update({'backend': 'Agg'})

在函数内添加行才能使聚合后端工作。