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Graphviz DOT 将节点排列成圆形，布局过于“紧凑”

发布于 2024-08-29 10:13:41 字数 552 浏览 3 评论 0原文

我已经完成一半，请查看编辑

好的，这是我的问题，我正在生成一个 python 模块的图表，包括所有文件及其函数/方法/类。

我想这样安排，节点围绕其父节点聚集成圆圈，当前所有内容都在一个巨大的水平行上，这使得该内容> 50k 像素宽，并且还让 svg 转换器失败（仅渲染大约一半的内容）图形）。

我浏览了 docs 但找不到任何似乎可以做到的内容诡计。

所以问题是：
有没有一种简单的方法可以做到这一点，或者我必须自己布局整个事情？：/

编辑：
感谢安德鲁斯的评论，我已经有了正确的布局，现在唯一的问题是它有点“紧凑”......所以现在的问题是，如何解决这个问题？

原文

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蓝眼泪 2024-09-05 10:13:41

我已经提到了影响当前布局的所有最重要的参数，然后是这些参数的建议值。不过，我怀疑您只需应用这些建议即可获得您想要的布局。

减小边权重，例如[weight=0.5]；这将使
边缘较长，导致紧
您当前在中看到的集群
图形“扇出”。
去掉节点边界，node_A
[颜色=无；形状=明文]；
特别是对于椭圆形节点，
占总数的很大一部分
节点空间“未使用”（即，未使用
显示节点标签）。
显式设置字体大小
节点（节点边界是
放大，使它们包围
节点文本，表示字体
给定的文本大小和数量
节点对其影响很大
尺寸）; [fontsize=11] 应该大
足够清晰但也减少
“杂乱”的外观（
默认大小为 14)。
增加之间的最小间隔
节点，通过“nodesep”；例如，nodesep=2.0；这将
直接提出您的反对意见
关于你的图表“太
紧凑。”（'nodesep' 和 'ranksep'
可能会影响 dot 绘制图表的方式
比任何其他参数都多
节点、边或图。就你而言，
看起来你只有两个等级
节点数； 'ranksep' 设置最小值
不同节点之间的距离
排名——看起来像所有节点
组成你的图表的是
相同等级（少数顶级除外）
中心的节点）。
显式设置总图表大小，例如，
size="7.75,10.25" （确保您的
图表适合 8.5 x 11 页面，并且
它占据了整个空间）
还有一个纯粹的美学建议
这最多只会帮助你
图表显得不那么混乱：
两个边缘的默认字体颜色和
节点是黑色的。大多数
你的图表上的墨水来自这两个
结构（特别是如果你
删除节点边框），所以我会
例如设置节点
（文本）字体颜色或边缘
字体颜色改为“蓝色”以帮助眼睛
区分两组图
结构。

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待＂谢繁草 2024-09-05 10:13:41

如果它太紧凑，你会想要弄乱边缘长度。根据图表布局，您有几个选项：

如果您的布局是 sfdp 或 fdp，请调整图表属性K。默认值为 0.3。
对于neato（或fdp），调整edge属性len。 neato 的默认值为 1.0，fdp 的默认值为 0.3。
对于点，您可以使用edge属性minlen，它是最小边缘长度。默认值为 1。

您可能还想修改决定聚类行为的图形属性 model。具体来说，尝试子集。我相信这可以为您处理len：
http://www.graphviz.org/doc/info/attrs.html #d:model

另外，您可以使用缩放技术来删除重叠：http://www.graphviz.org/doc/info/attrs.html#d:overlap

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困倦 2024-09-05 10:13:41

我有大约 500 个节点并使用了 doug 的推荐。

这是我的示例代码（在 python 中）：

f = Digraph('companies',filename='companies.gv',
          edge_attr={'weight':'1',
                     'fontsize':'11',
                     'fontcolor':'blue',
                     'len':'4'},
          graph_attr={'fixedsize':'false', 
                      'bgcolor':'transparent'},
          node_attr={'fontsize':'11', 
                     'shape':'plaintext', 
                     'color':'none',
                     'fontcolor':'black'})

f.attr(layout="neato")
f.attr(nodesep='3')
f.attr(ranksep='3')
f.attr(size='5000,5000')

I have around 500 nodes and used doug's recommendation.

This is my sample code that works (in python):

f = Digraph('companies',filename='companies.gv',
          edge_attr={'weight':'1',
                     'fontsize':'11',
                     'fontcolor':'blue',
                     'len':'4'},
          graph_attr={'fixedsize':'false', 
                      'bgcolor':'transparent'},
          node_attr={'fontsize':'11', 
                     'shape':'plaintext', 
                     'color':'none',
                     'fontcolor':'black'})

f.attr(layout="neato")
f.attr(nodesep='3')
f.attr(ranksep='3')
f.attr(size='5000,5000')

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