使用 mDCM 从 Dicom 文件中导出 JPG

Question

我使用 mDCM 和 C# 来查看 dicom 标签，但我试图将像素数据转换为位图并最终转换为 JPG 文件。我已阅读 mDCM Google Group 上有关该主题的所有帖子，并且所有代码示例要么不起作用，要么缺少重要的代码行。我正在处理的图像是 16 位单色1（这是提到的格式，但实际上是 16 位灰度）。我尝试过使用 LockBits、SetPixel 和不安全代码将像素数据转换为位图，但所有尝试都失败了。有谁有任何代码可以使这个工作。

这是我使用 SetPixel 的最新尝试：

DcmElement pixelData = this.currentFileFormat.Dataset.GetElement(new DcmTag(DcmConstTags.PixelData));
ushort[] pixels = this.currentPixelData.GetFrameDataU16(0);
this.currentImage = new Bitmap(this.currentPixelData.ImageWidth, this.currentPixelData.ImageHeight, PixelFormat.Format16bppRgb555);
int resample = (int)Math.Pow(2, (this.currentPixelData.BitsStored - 8));

int pxCounter = 0;
int min = ushort.MaxValue;
int max = 0;

for (int c = 0; c < this.currentPixelData.ImageHeight; c++)
{
    for (int r = 0; r < this.currentPixelData.ImageWidth; r++)
    {
        ushort pxColor = pixels[pxCounter];
        int temp = 255 - (pxColor / resample);
        if (temp < min) min = temp;
        if (temp > max) max = temp;
        this.currentImage.SetPixel(r, c, Color.FromArgb(temp, temp, temp));
        pxCounter++;
    }
}

更新： 通过使用 LockBits 和 Marshal.Copy，我已经接近了，但图像以彩虹色而不是灰度显示。所以我猜我需要一种将灰度数据转换为 RBG 格式的方法：

byte[] pixels = this.currentPixelData.GetFrameDataU8(frameIndex);
this.currentImage = new Bitmap(this.currentPixelData.ImageWidth, this.currentPixelData.ImageHeight, PixelFormat.Format16bppRgb555);
BitmapData bitmapData = this.currentImage.LockBits(new Rectangle(0, 0, this.currentImage.Width, this.currentImage.Height), ImageLockMode.ReadWrite, this.currentImage.PixelFormat);
System.Runtime.InteropServices.Marshal.Copy(pixels, 0, bitmapData.Scan0, this.currentImage.Width * this.currentImage.Height * 2);
this.currentImage.UnlockBits(bitmapData);

提前

致谢在有人建议尝试像 ClearCanvas 这样的其他东西之前，请知道 mDCM 是唯一适合我的需求的库，而 ClearCanvas 对于我需要做的事情来说太臃肿了。

Answer 1

我最终想通了，所以如果其他人偶然发现这个问题，我可以使用 CodeProject 文章中的代码显示并保存 16 位灰度图像。这是该文章的链接：

http://www.codeproject.com /KB/graphics/Image16bit.aspx?msg=3210733

Answer 2

太糟糕了，您没有将 GDCM 与 C# 一起使用。这将是一段 5 行代码：

http://gdcm.sourceforge .net/html/ExtractEncapsulatedFile.cs-example.html

Answer 3

我在 Atalasoft 工作，我们有一个成像组件可以为您完成此操作：

DicomDecoder decoder = new DicomDecoder();
using (AtalaImage image = decoder.Read(stream, frameIndex, null)) {
    AtalaImage imageToSave = null;
    if (image.PixelFormat == PixelFormat.Pixel16bppGrayscale) {
        imageToSave = image.GetChangedPixelFormat(PixelFormat.Pixel8bppGrayscale);
    }
    else if (image.PixelFormat == PixelFormat.Pixel48bppBgr) {
        imageToSave = image.GetChangedPixelFormat(PixelFormat.Pixel24bppBgr);
    }
    else {
        imageToSave = image;
    }
    imageToSave.Save(outputStream, new JpegEncoder(), null);
    if (imageToSave != image)
        imageToSave.Dispose();
}

这比它更冗长一些严格需要 - 我会制定一个例程，以适合您要使用的编码器的格式返回图像。一般来说，Jpeg 是它可以处理的相当有限的像素格式，而 dicom 可以封装一些相当宽的格式。 TIFF 可能是输出文件格式的更好选择。

我提出这一点是因为 DicomDecoder 对象自动处理 dicom 更深奥的像素格式，允许您在图像的原始空间中进行窗口和调平（又名亮度和对比度），以及获取标签，我们给您胜利/用于显示 AtalaImages 的 Web 表单控件，这可能会大大减小您的应用程序大小。

当然，有一系列合理的原因导致您可能被迫使用 mDCM，但我认为这可能会帮助您（或其他人）看到另一种选择。