在 Java/JRI 代码中加载 R 自己创建的库时出现问题
我创建了自己的新 R 库(称为“Media”)。当我尝试用RGui加载它时没有问题,并且可以调用新包中定义的函数。这就是我加载它的方式:
> library(Media)
但是,我也尝试从 Java/JRI 代码,当我加载新的 R 包时,Java 似乎没有找到该包,抛出消息“库(媒体)中的错误:未找到对象‘媒体’”
这是我当前使用 JRI 的代码:
REXP rexpSetFolder = re.eval("setwd('C:/Users/Albert/Documents')");
REXP rexpFolder = re.eval("getwd()");
System.out.println(rexpFolder.asString());
REXP rexpLoad = re.eval("library(Media)"); // fails
它也如果没有“setwd”命令,则会失败,并且对现有 R 函数的简单调用可以正常工作。我在 Windows 下使用 R 2.10 和最新的 JRI 0.5-0。
任何帮助将不胜感激。 非常感谢。
编辑:
参数lib.loc
似乎可以工作,至少这句话不会返回错误:
library("Media", lib.loc = "c:/Users/Albert/Documents")
但是之后,用re调用包中的函数.eval("myfunction()");
仍然失败,因为未正确找到该函数。
I created my own new R library (called "Media"). There is no problem when I try to load it with RGui, and I can call the functions defined in the new package. This is how I load it:
> library(Media)
But, I'm also trying to call that functions from Java/JRI code, and when I load the new R package, Java doesn't seem to find the pacakge, throwing the message "Error in library(Media) : object 'Media' not found"
This is my current code using JRI:
REXP rexpSetFolder = re.eval("setwd('C:/Users/Albert/Documents')");
REXP rexpFolder = re.eval("getwd()");
System.out.println(rexpFolder.asString());
REXP rexpLoad = re.eval("library(Media)"); // fails
It also fails without the 'setwd' command, and simple calls to existing R functions work fine. I'm using R 2.10 and the latest JRI 0.5-0 under Windows.
Any help would be appreciated.
Thank you very much.
Edit:
The parameter lib.loc
seems to work, at least this sentence does not return an error:
library("Media", lib.loc = "c:/Users/Albert/Documents")
But after that, calling a function in the package with re.eval("myfunction()");
still fails, as the function is not properly found.
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评论(3)
您可以修改库路径 - 请参阅 R 中的
?.libPaths
,您只需将您的私有库添加到该路径即可。 GUI 会为您完成此操作,但如果您在外面,则不会发生这种情况。例如:然后加载您的包。
You can modify the library path - see
?.libPaths
in R, you simply want to add your private library to the path. The GUI does that for you, but if you are outside it doesn't happen. For example:Then load your package.
您首先正确安装了库吗?您可能想尝试使用
lib.loc
参数。Did you install the library properly first? You might want to try using the
lib.loc
parameter.我的解决方法是将包从我的个人库 (%USERPROFILE%\Documents\R) 复制到全局库 (%R_HOME%\library)。
这不是最好的,因为这需要管理员权限,而并非所有用户都拥有......
My work-around was to copy the package from my personal library (%USERPROFILE%\Documents\R) to the global library (%R_HOME%\library).
It's not the best because this requires Administrator privileges which not all users will have...