有没有更好的方法在 R 中编码这个 sqlQuery？

Question

我正在编写一个 R 脚本来获取一些数据库数据，然后使用 RODBC 包对其进行处理。目前我所有的 sqlQuery 命令都是一长串；

stsample<-sqlQuery(odcon, paste"select * from bob.DESIGNSAMPLE T1, bob.DESIGNSUBJECTGROUP T2, bob.DESIGNEVENT T3, bob.CONFIGSAMPLETYPES T4 WHERE T1.SUBJECTGROUPID = T2.SUBJECTGROUPID AND T1.TREATMENTEVENTID = T3.TREATMENTEVENTID AND T1.SAMPLETYPEKEY = T4.SAMPLETYPEKEY AND T1.STUDYID = T2.STUDYID AND T1.STUDYID = T3.STUDYID AND T1.STUDYID = ", chstudid, sep=""))
head(stsample)

它看起来很丑并且很难阅读/更新。我尝试过将它们放在多行中，但是新行字符会妨碍，目前我最好的方法是使用大量粘贴；

stsample<-sqlQuery(odcon,
    paste(
        "select ",
            "* ", 
        "from ", 
            "BOB.DESIGNSAMPLE T1, ",
            "BOB.DESIGNSUBJECTGROUP T2, ",
            "BOB.DESIGNEVENT T3, ",
            "BOB.CONFIGSAMPLETYPES T4 ",
        "WHERE ",
            "T1.SUBJECTGROUPID = T2.SUBJECTGROUPID ",
            "AND T1.TREATMENTEVENTID = T3.TREATMENTEVENTID ",
            "AND T1.SAMPLETYPEKEY = T4.SAMPLETYPEKEY ",
            "AND T1.STUDYID = T2.STUDYID ",
            "AND T1.STUDYID = T3.STUDYID ",
            "AND T1.STUDYID = ",chstudid,
        sep="")
    )
head(stsample)

但我不喜欢必须在每一行周围加上引号，并让我的空格正确。有更好的办法吗？

Answer 1

我会使用这样的东西：

stsample<-sqlQuery(odcon,
    paste("
####DATASET CONSTRUCTION QUERY #########
    select 
    *  
    from 
    BOB.DESIGNSAMPLE T1, 
    BOB.DESIGNSUBJECTGROUP T2, 
    BOB.DESIGNEVENT T3, 
    BOB.CONFIGSAMPLETYPES T4 
    WHERE 
    T1.SUBJECTGROUPID = T2.SUBJECTGROUPID 
    AND T1.TREATMENTEVENTID = T3.TREATMENTEVENTID 
    AND T1.SAMPLETYPEKEY = T4.SAMPLETYPEKEY 
    AND T1.STUDYID = T2.STUDYID 
    AND T1.STUDYID = T3.STUDYID 
    AND T1.STUDYID = 
###################################   
    ", as.character(chstudid), sep="")
    )

Answer 2

使用 gsub("\n", " ", "long multiline select string") 而不是粘贴怎么样？

Answer 3

这是一个非常古老的问题，但认为这可能对某人有用。

我发现有用的一件事是 GetoptLong 包，它提供 qq() 函数。我认为它是受到 Perl 的启发，但本质上它提供了一种通过简单的变量插值来处理多行字符串的方法。例如：

library(GetoptLong)

tableName <- "myTable"
id <- 42

sqlQuery(odcon, qq("
    SELECT * FROM @{tableName}
    WHERE id = @{id}
    LIMIT 1
")

显然，我应该提到通常的警告，如果您直接处理用户输入，这是一个坏主意，在这种情况下最好使用某种准备好的语句。