通过 XGrid 运行 BLAST

Question

有人有使用 XGrid 运行 BLAST 的经验吗？

谷歌搜索显示存在一个名为“Xgrid BLAST”的工具，但不知道在哪里可以找到。

Answer 1

BLAST 包含在 Xgrid 中。引用自“基于 Mac OS X 的本地网格的利用使用 Xgrid 的计算机”：

Xgrid 包括一个强大的、
可定制的通用作业
提交界面和Xgrid BLAST，
一个功能齐全、支持网格的
基于Xgrid技术的应用
运行 NCBI BLAST 实例
局部比对搜索算法工具。

安装 Xgrid 后，您可以在任何客户端计算机上打开 /Applications/Xgrid BLAST.app。

有关详细信息，请参阅：

• Xgrid 安装文档由犹他大学。
• 如何使用 Apple 的 xgrid 运行 BLAST 作业 由 NACS 研究计算支持小组
• Xgrid 基础知识由爱丁堡大学进化生物学研究所 Blaxter 实验室提供。它包含一个用于提交 BLAST 作业的示例 Perl 文件到 Xgrid。

最后提示，如果您对未来有任何与生物信息学相关的问题，有一个专门针对生物信息学家的 StackOverflow 克隆，名为 BioStars。您可能会在那里得到更快的答案。