检查 S4 方法

Question

如何查看S4函数的定义？例如，我想查看 TSdbi 包中 TSconnect 的定义。该命令

showMethods("TSconnect")

显示，除其他外，还有 drv="histQuoteDriver"、dbname="character" 的函数。

我怎样才能看到这个函数的定义呢？如果它是 S3 函数，则只有第一个可定义参数 (drv)，可以使用 print(TSconnect.histQuoteDriver) 检查该参数。

编辑：从 r-forge 中我找到了所需的输出：

setMethod("TSconnect",   signature(drv="histQuoteDriver", dbname="character"),
  definition= function(drv, dbname, user="", password="", host="", ...){
   #  user / password / host  for future consideration
   if (is.null(dbname)) stop("dbname must be specified")
   if (dbname == "yahoo") {
      con <- try(url("http://quote.yahoo.com"), silent = TRUE)
      if(inherits(con, "try-error")) 
         stop("Could not establish TShistQuoteConnection to ",  dbname)
      close(con)
      }
   else if (dbname == "oanda") {
      con <- try(url("http://www.oanda.com"),   silent = TRUE)
      if(inherits(con, "try-error")) 
         stop("Could not establish TShistQuoteConnection to ",  dbname)
      close(con)
      }
   else 
      warning(dbname, "not recognized. Connection assumed working, but not tested.")

   new("TShistQuoteConnection", drv="histQuote", dbname=dbname, hasVintages=FALSE, hasPanels=FALSE,
        user = user, password = password, host = host ) 
   } )

有没有办法从 R 会话中获取此定义？

Answer 1

S4 类相对复杂，所以我建议阅读这篇介绍。

在本例中，TSdbi 是通用 S4 类的一个示例，它由所有特定数据库包（例如 TSMySQL、TSPostgreSQL 等）进行扩展。 TSdbi 中的 TSconnect() 方法与您所看到的没什么不同：drv="character"、dbname="character" 是函数的参数，而不是函数本身。如果您安装一些特定的数据库包并使用 showMethods("TSconnect")，您将看到该函数的所有特定实例。如果您随后使用特定的数据库驱动程序调用 TSconnect()，它将使用适当的函数。

摘要等功能也是如此。例如，尝试调用 showMethods(summary)。根据加载的包，您应该看到返回的多个方法

您可以在 R-Forge 上轻松查看它的源代码： http://r-forge.r-project.org/plugins/scmsvn/ viewcvs.php/pkg/TSdbi/R/TSdbi.R?rev=70&root=tsdbi&view=markup。这是该函数的范围：

setGeneric("TSconnect", def= function(drv, dbname, ...) standardGeneric("TSconnect"))

setMethod("TSconnect",   signature(drv="character", dbname="character"),
   definition=function(drv, dbname, ...)
             TSconnect(dbDriver(drv), dbname=dbname, ...))