使用稀疏矩阵和glmnet时出现奇怪的错误

发布于 2024-08-10 23:22:56 字数 216 浏览 2 评论 0原文

我在训练 glmnet 回归时遇到奇怪的错误。

invalid class "dgCMatrix" object: length(Dimnames[[2]])' must match Dim[2] 

它只是偶尔发生,而且可能只在较大的数据集下发生。

我不确定在给定特定数据集的情况下发生的情况是否一致。

有什么线索吗?

I'm getting a weird error when training a glmnet regression.

invalid class "dgCMatrix" object: length(Dimnames[[2]])' must match Dim[2] 

It only happens occasionally, and perhaps only under larger datasets.

I'm not sure whether it's consistent it happens given a certain dataset.

Any clues?

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评论(3

征﹌骨岁月お 2024-08-17 23:22:56

在不了解该软件包的详细信息的情况下,John Chambers“Data Analsys 软件”(2008 年,Springer)对调试进行了很好的讨论,例如 via

> options(error=recover) 

可能会在这里有所帮助。

Without knowing the particulars of this packages, John Chambers "Software for Data Analsys" (2008, Springer) has a good discussion on debugging, for example via

> options(error=recover) 

which may be of help here.

淑女气质 2024-08-17 23:22:56

我在使用 family='binomial' 时不断遇到相同的错误。结果我的响应变量中的事件/案例太少了。在 cv.glmnet 中使用 nfold=10 ,如果我的二进制响应 [0,1] 出现的时间少于约 2%,我会收到错误。我建议让您的脚本检查这种情况,并在 true 时使用 glmnet。不过,您不会从选择 lambda 的 x 验证中受益。

I kept getting the same error while using family='binomial'. Turns out I had too few events/cases in my response variable. Using nfold=10 in cv.glmnet, I would get the error if my binary response [0,1] occured less than ~2% of the time. I recommend having your script check for this scenario and use glmnet when true. You won't get the benefit of the x validation for selecting lambda though.

佼人 2024-08-17 23:22:56

以上需要澄清一下。我在使用 cv.glmnet() 时遇到了这个问题。通过识别那些案例太少的实例,我改用 glmnet() 。您失去了交叉验证的好处(即估计 lambda),但它会编译。

Need to clarify the above. I had this problem when using cv.glmnet(). By identifying those instances where there are too few cases, I used glmnet() instead. You lose the benefit of the cross validation (i.e. estimating lambda), but it will complile.

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