将汇总统计数据（甚至原始数据点）添加到躲避位置箱线图中

Question

假设您有以下数据集：

trt <- ifelse(runif(100)<0.5,"drug","placebo")
inj.site <- ifelse(runif(100)<0.5,"ankle","wrist")
relief <- 20 + 0.5*(inj.site=="ankle") + 0.5*(trt=="drug") + rnorm(100)
to.analyze <- data.frame(trt,inj.site,relief)

现在，我们的想法是制作一个箱线图，其中 x 轴上有损伤部位，并并排有治疗箱：

bplot <- ggplot(to.analyze,aes(inj.site,relief,fill=trt)) + geom_boxplot(position="dodge")

很简单。但现在我想在框的顶部添加原始数据点。如果我没有带有 position="dodge" 的框，这会很容易：

bplot + geom_point(aes(colour=trt))

但是，这会在框之间绘制点，并添加 position="dodge" >对于这个几何形状似乎不起作用。我如何调整它以便在方框上绘制点？

奖励：与使用 stat_summary(blah,y.fun=mean,shape="+") 过度绘制均值的情况相同，也有同样的问题。

Answer 1

如果我在这里错了，哈德利无疑会纠正我......

这是自然语法：

bplot + geom_point(aes(colour=trt), position=position_dodge(width=.5))

（position =“dodge”将做同样的事情，没有参数。）

当我绘制它时，我得到一些看起来像position_jitter（ ），这大概也是你得到的。

出于好奇，我查看了源代码，在那里我找到了 pos_dodge() 函数。 （在 R 提示符下输入 pos_dodge 即可查看...）到此结束：

within(df, {
  xmin <- xmin + width / n * (seq_len(n) - 1) - diff * (n - 1) / (2 * n)
  xmax <- xmin + d_width / n
  x <- (xmin + xmax) / 2
})

n 是数据框的行数。所以看起来它正在以行索引的分数来躲避各个点！所以第一个点是闪避的 width/n，第二个点是闪避的 2 * width/n，最后一个点是闪避的 n * width/n。

这显然不是您的意思，尽管这是您所说的。您可能会陷入手动重新创建躲避的箱线图，或使用不同的可视化（例如分面）的困境？

ggplot(to.analyze,aes(inj.site,relief)) + geom_boxplot() + facet_wrap(~ trt)