从 data.frame 创建邻接列表

Question

我有一个包含 2 列的 data.frame：节点 A、节点 B。框架中的每个条目都意味着节点 A 和 B 之间的图中的一条边。

必须有一个很好的单行线来将此 data.frame 转换为邻接关系列表。 有什么提示吗？

Answer 1

既然您标记了此 igraph，那么使用内置功能怎么样？功能？

> g <- graph.data.frame( edges )
> adjlist <- get.adjedgelist(g)

唯一需要注意的是顶点索引为零，这将在 igraph 0.6 中发生变化。

Answer 2

又快又脏……

> edges <- data.frame(nodea=c(1,2,4,2,1), nodeb=c(1,2,3,4,5))

> adjlist <- by(edges, edges$nodea, function(x) x$nodeb)

> for (i in as.character(unique(edges$nodea))) {
+   cat(i, ' -> ', adjlist[[i]], '\n')
+ }

1  ->  1 5
2  ->  2 4
4  ->  3

> adjlist
edges$nodea: 1
[1] 1 5
------------------------------------------------------------
edges$nodea: 2
[1] 2 4
------------------------------------------------------------
edges$nodea: 4
[1] 3

Answer 3

> edges <- data.frame(nodea=c(1,2,4,2,1), nodeb=c(1,2,3,4,5))

> attach(edges)

> tapply(nodeb,nodea,unique)

1`
[1] 1 5

2`
[1] 2 4

4`
[1] 3

Answer 4

你会如何在 R 中表示邻接表？ 它需要可变大小的列表来存储相邻节点的集合； 所以你必须使用 list(); 但是在 R 中使用它有什么好处呢？

我可以想到类似 sapply 的函数的蹩脚技巧，但它们对每个节点进行线性扫描。 但玩了一分钟，这里是：一个配对列表的列表，其中每对的第二项是邻接列表。 输出比数据结构实际更疯狂。

> edgelist=data.frame(A=c(1,1,2,2,2),B=c(1,2,2,3,4))
> library(plyr)
> llply(1:max(edgelist), function(a) list(node=a, adjacents=as.list(edgelist$B[edgelist$A==a])))
[[1]]
[[1]]$node
[1] 1

[[1]]$adjacents
[[1]]$adjacents[[1]]
[1] 1

[[1]]$adjacents[[2]]
[1] 2



[[2]]
[[2]]$node
[1] 2

[[2]]$adjacents
[[2]]$adjacents[[1]]
[1] 2

[[2]]$adjacents[[2]]
[1] 3

[[2]]$adjacents[[3]]
[1] 4



[[3]]
[[3]]$node
[1] 3

[[3]]$adjacents
list()


[[4]]
[[4]]$node
[1] 4

[[4]]$adjacents
list()