如何根据list列表中每一行为开头信息，将另一个data.txt中相关信息（带颜色部分）提取出来，并存储在新的result.txt中

Question

list列表如下

NAME:[193895-21-5]{A}#R001#
NAME:[193895-26-0]{B}#R001#
NAME:[193895-49-7]{C}#R001#
NAME:[369616-51-3]{D}#R001#
NAME:[416843-85-1]{E}#R001#

data.txt如下 

NAME:[193895-21-5]{A}#R001#
SCANNUMBER: 64
RETENTIONTIME: 0.01633333
PRECURSORMZ: 113.9629
INTENSITY: 1083
METABOLITEN****AME: 
PRECURSORTYPE: [M+H]+
ISOTOPE: M + 0
Num Peaks: 0

$$$$
NAME:Unknown
SCANNUMBER: 64
RETENTIONTIME: 0.01633333
PRECURSORMZ: 152.9435
INTENSITY: 521.0625
METABOLITEN****AME: 
PRECURSORTYPE: [M+H]+
ISOTOPE: M + 0
Num Peaks: 0

$$$$
NAME:[193895-26-0]{B}#R001#
SCANNUMBER: 64
RETENTIONTIME: 0.01633333
PRECURSORMZ: 164.9196
INTENSITY: 388.8125
METABOLITEN****AME: 
PRECURSORTYPE: [M+H]+
ISOTOPE: M + 0
Num Peaks: 0

$$$$
NAME:Unknown
SCANNUMBER: 64
RETENTIONTIME: 0.01633333
PRECURSORMZ: 214.9177
INTENSITY: 9629.813
METABOLITEN****AME: 
PRECURSORTYPE: [M+H]+
ISOTOPE: M + 0
Num Peaks: 0

$$$$
NAME:[193895-49-7]{C}#R001#
SCANNUMBER: 64
RETENTIONTIME: 0.01633333
PRECURSORMZ: 232.8915
INTENSITY: 167.125
METABOLITEN****AME: 
PRECURSORTYPE: [M+H]+
ISOTOPE: M + 0
Num Peaks: 0

$$$$
NAME:[416843-85-1]{E}#R001#
SCANNUMBER: 64
RETENTIONTIME: 0.01633333
PRECURSORMZ: 214.9177
INTENSITY: 9629.813
METABOLITEN****AME: 
PRECURSORTYPE: [M+H]+
ISOTOPE: M + 0
Num Peaks: 0

$$$$
NAME:Unknown
SCANNUMBER: 64
RETENTIONTIME: 0.01633333
PRECURSORMZ: 214.9177
INTENSITY: 9629.813
METABOLITEN****AME: 
PRECURSORTYPE: [M+H]+
ISOTOPE: M + 0
Num Peaks: 0

$$$$
NAME:Unknown
SCANNUMBER: 64
RETENTIONTIME: 0.01633333
PRECURSORMZ: 214.9177
INTENSITY: 9629.813
METABOLITEN****AME: 
PRECURSORTYPE: [M+H]+
ISOTOPE: M + 0
Num Peaks: 0

$$$$
NAME:[369616-51-3]{D}#R001#
SCANNUMBER: 64
RETENTIONTIME: 0.01633333
PRECURSORMZ: 214.9177
INTENSITY: 9629.813
METABOLITEN****AME: 
PRECURSORTYPE: [M+H]+
ISOTOPE: M + 0
Num Peaks: 0

$$$$

 

Answer 1

data.txt如下 

NAME:[193895-21-5]{A}#R001#
SCANNUMBER: 64
RETENTIONTIME: 0.01633333
PRECURSORMZ: 113.9629
INTENSITY: 1083
METABOLITEN****AME: 
PRECURSORTYPE: [M+H]+
ISOTOPE: M + 0
Num Peaks: 0

$$$$
NAME:Unknown
SCANNUMBER: 64
RETENTIONTIME: 0.01633333
PRECURSORMZ: 152.9435
INTENSITY: 521.0625
METABOLITEN****AME: 
PRECURSORTYPE: [M+H]+
ISOTOPE: M + 0

Num Peaks: 6
334.04218    59
335.09433    2976
557.4165    44
575.42139    44
759.46497    920
805.44159    59
 

$$$$
NAME:[193895-26-0]{B}#R001#
SCANNUMBER: 64
RETENTIONTIME: 0.01633333
PRECURSORMZ: 164.9196
INTENSITY: 388.8125
METABOLITEN****AME: 
PRECURSORTYPE: [M+H]+
ISOTOPE: M + 0
Num Peaks: 6
334.04218    59
335.09433    2976
557.4165    44
575.42139    44
759.46497    920
805.44159    59

$$$$
NAME:Unknown
SCANNUMBER: 64
RETENTIONTIME: 0.01633333
PRECURSORMZ: 214.9177
INTENSITY: 9629.813
METABOLITEN****AME: 
PRECURSORTYPE: [M+H]+
ISOTOPE: M + 0

Num Peaks: 6
334.04218    59
335.09433    2976
557.4165    44
575.42139    44
759.46497    920
805.44159    59
 

$$$$
NAME:[193895-49-7]{C}#R001#
SCANNUMBER: 64
RETENTIONTIME: 0.01633333
PRECURSORMZ: 232.8915
INTENSITY: 167.125
METABOLITEN****AME: 
PRECURSORTYPE: [M+H]+
ISOTOPE: M + 0
Num Peaks: 6
334.04218    59
335.09433    2976
557.4165    44
575.42139    44
759.46497    920
805.44159    59
 

$$$$
NAME:[416843-85-1]{E}#R001#
SCANNUMBER: 64
RETENTIONTIME: 0.01633333
PRECURSORMZ: 214.9177
INTENSITY: 9629.813
METABOLITEN****AME: 
PRECURSORTYPE: [M+H]+
ISOTOPE: M + 0
Num Peaks: 0

$$$$
NAME:Unknown
SCANNUMBER: 64
RETENTIONTIME: 0.01633333
PRECURSORMZ: 214.9177
INTENSITY: 9629.813
METABOLITEN****AME: 
PRECURSORTYPE: [M+H]+
ISOTOPE: M + 0
Num Peaks: 0

$$$$
NAME:Unknown
SCANNUMBER: 64
RETENTIONTIME: 0.01633333
PRECURSORMZ: 214.9177
INTENSITY: 9629.813
METABOLITEN****AME: 
PRECURSORTYPE: [M+H]+
ISOTOPE: M + 0
Num Peaks: 0

$$$$
NAME:[369616-51-3]{D}#R001#
SCANNUMBER: 64
RETENTIONTIME: 0.01633333
PRECURSORMZ: 214.9177
INTENSITY: 9629.813
METABOLITEN****AME: 
PRECURSORTYPE: [M+H]+
ISOTOPE: M + 0
Num Peaks: 0

$$$$

Answer 2

谢谢你啊，有个地方有点问题啊。data.txt是数据库文件，需要都提取。我把data.txt文件加入了写数据。Num Peaks:下面还有些数据需要一起提取出来。我试了试您这个脚本，Num Peaks:下的数据没有提取出来。麻烦您帮修改下啊

Answer 3

有个bug，如果list中的目标，再data没有的话 脚本不运行啊

Answer 4

回复
已将代码修改，并测试，并回答。请试一试。

Answer 5

回复
有空我就会来处理这个bug。很高兴和你交流。

Answer 6

回复
@tcxu : 你也想一想如何是好。你看懂代码了吗？

Answer 7

1.    在 data.txt 文档中，开头为：
NAME:[193895-21-5]{A}#R001#
NAME:[369616-51-3]{D}#R001# 
的相关信息，为什么不带颜色？ 它们的相关信息，是否也要存储在新的result.txt中？

2.    "$$$$" 不是相关信息，不必存储到新的result.txt中, 但用作分隔不同信息的记号，又有必要存进。 对吗？

3.   下列代码，是否附合你的要求？

fo = open("data.txt", "r")
list = open("list.txt", "r")
result = open("result.txt", "w")

str=""
input=[]
checkList=[]

for line in list.readlines():
    line = line.strip()
    checkList.append(line)

for line in fo.readlines():
    line = line.strip()
    input.append(line)

for line in checkList:
    n = input.index(line)
    for line in input[n: n+9]:
        str +=line + 'n'
    str +='$$n'
result.write(str)

fo.close()
list.close()
result.close()

 

Answer 8

万分感谢啊 。perfect

Answer 9

回复
我已经将代码稍作修改，以保证：如果 list.txt 中的目标，在 data.txt 没有的话, 脚本也不会停止运行。并添加了加 注释。请进一步测试。

Answer 10

fo = open("data.txt", "r")
list = open("list.txt", "r")
result = open("result.txt", "w")

str=""
input=[]
checkList=[]

for line in list.readlines():#　读取　list.txt 的全部内容
    line = line.strip()#　去掉每行首尾的空格
    checkList.append(line)#　将　每行内容　存入列表　checkList

for line in fo.readlines():#　读取　data.txt 的全部内容
    line = line.strip()#　去掉每行首尾的空格
    input.append(line)#　将　每行内容　存入列表 input

for line in checkList:# 逐行处理 list.txt 所列的内容
    try:
        n = input.index(line)# 按　list.txt 的每行内容，查询　data.txt　保存的有关信息
    except ValueError:# 　处理没找到内容的场景
        print("没有找到　" + line + "　的相关信息。")#　输出错误信息
    else:#　否则逐行将信息存入(追加到)字符串 str 尾
        value = input[n]
        while (len( value) > 1) and value !='$$':#　若遇到　"$$", 则结束添加任务
            str += value+"n"
            n=n+1
            value = input[n]
        str +='n$$nn'

result.write(str)#　最终，将字符串的内容，写到文档　result.txt　之中

fo.close()
list.close()
result.close()