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标准数组子类

发布于 2023-06-23 19:27:33 字数 27899 浏览 0 评论 0 收藏 0

注意

可以对 numpy.ndarray 进行子类化, 但如果您的目标是创建具有 修改 的行为的数组, 就像用于分布式计算的Dask数组和用于基于GPU的计算的cupy数组一样,则不鼓励子类化。 相反,建议使用 numpy 的调度机制

如果需要,可以从( Python 或 C )继承 ndarrayopen in new window。 因此,它可以形成许多有用的类的基础。 通常是对数组对象进行子类,还是简单地将核心数组件用作新类的内部部分,这是一个困难的决定,可能只是一个选择的问题。 NumPy有几个工具可以简化新对象与其他数组对象的交互方式,因此最终选择可能并不重要。 简化问题的一种方法是问问自己,您感兴趣的对象是否可以替换为单个数组,或者它的核心是否真的需要两个或更多个数组。

注意,asarrayopen in new window 总是返回基类ndarray。 如果您确信使用数组对象可以处理ndarray的任何子类, 那么可以使用 asanyarrayopen in new window 来允许子类通过您的子例程更干净地传播。 原则上,子类可以重新定义数组的任何方面,因此,在严格的指导原则下,asanyarrayopen in new window 很少有用。 然而,数组对象的大多数子类不会重新定义数组对象的某些方面,例如Buffer接口或数组的属性。 但是,子例程可能无法处理数组的任意子类的一个重要示例是,矩阵将 “*” 运算符重新定义为矩阵乘法,而不是逐个元素的乘法。

特殊属性和方法

另见

子类化ndarray

NumPy提供了几个类可以自定义的钩子:

  • class.__array_ufunc__(ufunc, method, *inputs, **kwargs)

    版本1.13中的新功能。

    任何类,ndarray子类是否可以定义此方法或将其设置为 Noneopen in new window 以覆盖NumPy的ufuncs的行为。 这与Python的__mul__和其他二进制操作例程非常相似。

    • ufunc 是被调用的ufunc对象。
    • method 是一个字符串,指示调用了哪个Ufunc方法("__call__""reduce""acculate""outer""internal" 之一)。
    • inputsufunc 的输入参数的元组。
    • kwargs 是包含ufunc的可选输入参数的字典。 如果给定,任何 out 参数(包括位置参数和关键字)都将作为kwargs中的 元组open in new window 传递。有关详细信息,请参阅 通函数(ufunc) 中的讨论。

    该方法应返回操作的结果,如果未实现请求的操作,则返回 NotImplementedopen in new window

    如果输入或输出参数之一具有 __array_ufunc__ 方法,则执行该方法而不是ufunc。 如果多个参数实现 __array_ufunc__ ,则按顺序尝试它们:子类在超类之前,输入在输出之前,否则从左到右。 返回 NotImplementedopen in new window 以外的内容的第一个例程确定结果。 如果所有 __array_ufunc__ 操作都返回 NotImplementedopen in new window,则会引发 TypeErroropen in new window

    注意

    我们打算将numpy函数重新实现为((通用的)ufunc,在这种情况下, 它们将可能被 __array_ufunc__ 方法覆盖。 一个主要的候选是 matmulopen in new window,它目前不是Ufunc, 但可以相对容易地重写为(一组)通用Ufuncs。 对于medianopen in new windowaminopen in new windowargsortopen in new window 等函数,可能会发生相同的情况。

    与python中的其他一些特殊方法一样,例如 __hash____iter__, 可以通过设置 __array_ufunc__ = None 来指示您的类不支持ufuncs。 当对设置 __array_ufunc__ = None 的对象调用时,ufuncs 总是引发 TypeErroropen in new window

    当 arr 是 ndarrayopen in new windowobj 是自定义类的实例时, __array_ufunc__的存在也会影响 ndarrayopen in new window 处理 arr + objarr < obj 等二进制操作的方式。 有两种可能性。如果 obj.__array_ufunc__ 存在而不是 Noneopen in new window, 则 ndarray.__add__ 和 friends 将委托给 ufunc 机器, 这意味着 arr + obj 变为 np.add(arr,obj),然后 addopen in new window 调用 obj.__array_ufunc__。 如果您想定义一个像数组一样作用的对象,这是很有用的。

    或者,如果 obj.__array_ufunc__ 设置为 Noneopen in new window, 那么作为一种特殊情况,像 ndarray.__add__ 这样的特殊方法会注意到这一点,并 无条件 地引发 TypeErroropen in new window。 如果要创建通过二进制操作与数组交互的对象,但本身不是数组,则这很有用。 例如,单位处理系统可能具有表示 “meters” 单位的对象 m,并且希望支持语法 arr * m 来表示数组具有 “meters” 单位, 但不想通过 ufuncs 或其他方式与数组交互。 这可以通过设置 __array_ufunc_ = none 并定义 __mul___rmul__ 方法来完成。 (请注意,这意味着编写始终返回 NotImplementedopen in new window__array_ufunc__ 与设置 __array_ufunc__ = none 并不完全相同: 在前一种情况下,arr + obj 将引发 TypeErroropen in new window,而在后一种情况下,可以定义 __radd__ 方法来防止这种情况。)

    以上不适用于 in-place 操作符,ndarrayopen in new window 从不返回 NotImplementedopen in new window。因此,arr += obj 总是会导致 TypeErroropen in new window。这是因为对于数组来说,in-place 操作一般不能被简单的反向操作所取代。(例如,默认情况下,arr += obj 将被转换为 arr= arr + obj,即 arr 将被替换,这与就地数组操作的预期相反。)

    注意

    如果定义 __array_ufunc__

    注意

    如果类定义了 __array_ufunc__ 方法,这将禁用下面为 ufuncs 描述的 __array_wrap____array_prepare____array_priority__ 机制(最终可能会被弃用)。

  • class.__array_function__(func, types, args, kwargs)

    版本1.16中的新增功能。

    注意

    • 在NumPy 1.17中,默认情况下启用该协议,但可以禁用该协议,设置 NUMPY_EXPERIMENTAL_ARRAY_FUNCTION = 0
    • 在NumPy 1.16中,您需要设置环境变量
    • 在NumPy 1.16中,您需要在导入NumPy之前设置环境变量 NUMPY_EXPERIMENTAL_ARRAY_FUNCTION = 1 以使用NumPy函数覆盖。
    • 最终,期望始终启用__array_function__
    • func 是由NumPy的公共API公开的任意可调用的,它以 func(*args, **kwargs) 的形式调用。
    • types 是来自实现 array_function 的原始NumPy函数调用的唯一参数类型的集合
    • 元组 args 和dict kwargs 直接从原始调用传递。

    为了方便 __array_function__ 实现者,types 为所有参数类型提供了 '__array_function__' 属性。 这允许实现者快速识别他们应该遵循其他参数的 __array_function__ 实现的情况。 实现不应该依赖于类型的迭代顺序。

    __array_function__ 的大多数实现都将从两个检查开始:

    1. 给定的函数是否知道如何重载?
    2. 我们知道如何处理的类型的所有参数都是?

    如果这些条件成立,__array_function__ 应该返回调用 func(*args, **kwargs) 实现的结果。 否则,它应该返回 sentinel 值 NotImplemented,表示该函数未由这些类型实现。

    __array_function__ 的返回值没有一般要求,尽管大多数合理的实现应该返回与函数参数之一具有相同类型的数组。

    还可以方便地定义用于注册 __array_function__ 实现的自定义装饰器(比如下面的实现(implements))。

    HANDLED_FUNCTIONS = {}
    
    class MyArray:
        def __array_function__(self, func, types, args, kwargs):
            if func not in HANDLED_FUNCTIONS:
                return NotImplemented
            # Note: this allows subclasses that don't override
            # __array_function__ to handle MyArray objects
            if not all(issubclass(t, MyArray) for t in types):
                return NotImplemented
            return HANDLED_FUNCTIONS[func](*args, **kwargs)
    
    def implements(numpy_function):
        """Register an __array_function__ implementation for MyArray objects."""
        def decorator(func):
            HANDLED_FUNCTIONS[numpy_function] = func
            return func
        return decorator
    
    @implements(np.concatenate)
    def concatenate(arrays, axis=0, out=None):
        ...  # implementation of concatenate for MyArray objects
    
    @implements(np.broadcast_to)
    def broadcast_to(array, shape):
        ...  # implementation of broadcast_to for MyArray objects
    

    请注意,__array_function__ 实现不需要包含 所有 相应的NumPy函数的可选参数 (例如,上面的 broadcast_to 省略了无关的 subok 参数)。 如果在NumPy函数调用中明确使用了可选参数,则它们仅传递给 __array_function__

    就像内置特殊方法(如 __add__ )的情况一样, 正确编写的 __array_function__ 方法应始终在遇到未知类型时返回 NotImplemented。 否则,如果操作还包含一个对象,则无法从另一个对象正确覆盖NumPy函数。

    在大多数情况下,__array_function__ 的调度规则与 __array_ufunc__ 的调度规则相匹配。尤其是:

    • NumPy将从所有指定的输入中收集 __array_function__ 的实现,并按顺序调用它们:超类之前的子类,否则从左到右。 请注意,在涉及子类的某些边缘情况下,这与Python的当前行为open in new window略有不同。
    • __array_function__ 的实现表明它们可以通过返回除 NotImplemented 之外的任何值来处理操作。
    • 如果所有 __array_function__ 方法都返回 NotImplemented,NumPy 将引发 TypeError

    如果不存在 __array_function__ 方法,NumPy将默认调用自己的实现,用于NumPy数组。 例如,当所有类似数组的参数都是Python数字或列表时,会出现这种情况。 (NumPy数组确实有一个 __array_function__ 方法, 如下所示,但如果除NumPy数组子类之外的任何参数都实现了 __array_function__,它总是返回 NotImplemented。)

    __array_ufunc__ 的当前行为的一个偏差是,NumPy将仅对每个唯一类型的第一个参数调用 __array_function__。 这与Python调用反射方法的规则相匹配open in new window,这确保了检查重载具有可接受的性能,即使存在大量重载参数。

  • class.__array_finalize__(obj)

    只要系统在内部从 obj 分配一个新数组,就会调用此方法,其中 objndarrayopen in new window 的子类(子类型)。 它可以用于在构造之后更改 self 的属性(例如,以确保二维矩阵), 或者从“父”更新元信息。子类继承此方法的默认实现,该方法不执行任何操作。

  • class.__array_prepare__(array, context=None)

    在每个ufunc的开头,在具有最高数组优先级的输入对象上调用此方法,如果指定了一个输出对象,则调用此方法。 传入输出数组,返回的任何内容都传递给 ufunc。 子类继承此方法的默认实现,它只是简单地返回未修改的输出数组。 子类可以选择使用此方法将输出数组转换为子类的实例,并在将数组返回到ufunc进行计算之前更新元数据。

    注意

    对于 ufuncs,希望最终弃用这个方法,而不是 __array_ufunc__

  • class.__array_wrap__(array, context=None)

    在每个 ufunc 的末尾, 对具有最高数组优先级的输入对象或输出对象(如果指定了一个)调用此方法。 传入ufunc计算的数组,并将返回的任何内容传递给用户。 子类继承此方法的默认实现,该方法将数组转换为对象类的新实例。 子类可以选择使用此方法将输出数组转换为子类的实例,并在将数组返回给用户之前更新元数据。

    注意

    对于ufuncs,希望最终弃用此方法,取而代之的是 __array_ufunc__

  • class.__array_priority__

    该属性的值用于确定在返回对象的Python类型有多种可能性的情况下返回哪种类型的对象。子类继承此属性的默认值0.0。

    注意

    对于ufuncs,希望最终弃用此方法,取而代之的是 __array_ufunc__

  • class.__array__([dtype])

    如果将具有 __array__ 方法的类(是否ndarray子类)用作 ufunc 的输出对象, 则结果将写入 __array__ 返回的对象。在输入数组上进行类似的转换。

矩阵对象

注意

强烈建议不要使用矩阵子类。如下所述,它使得编写一致处理矩阵和规则数组的函数变得非常困难。 目前,它们主要用于与 scipy.sparse 进行交互。 但是,我们希望为此用途提供一种替代方法,并最终删除 matrix 子类。

matrixopen in new window 对象继承自ndarray,因此它们具有ndarray的相同属性和方法。 但是,当您使用矩阵但希望它们像数组一样工作时,可能会导致意外结果的矩阵对象有六个重要差异:

  1. 可以使用字符串表示法创建 Matrix 对象,以允许 Matlab 样式的语法,其中空格分隔列,分号 (';') 分隔行。

  2. Matrix对象始终是二维的。这具有深远的含义,因为 m.ravel() 仍然是二维的(第一维为1),并且 item selection 返回二维对象,因此序列行为与数组根本不同。

  3. 矩阵对象覆盖乘法成为矩阵乘法。确保您了解您可能希望接收矩阵的函数的这一点。特别是考虑到当m是矩阵时 asanyarray(m) 返回矩阵的事实。

  4. 矩阵对象超越幂被矩阵提升为幂。关于在使用 asanyarray(…) 的函数中使用电源的相同警告。获取此事实的数组对象保持。

  5. 矩阵对象的默认 __array_priority__ 为10.0,因此与ndarray的混合运算始终生成矩阵。

  6. 矩阵具有使计算更容易的特殊属性。这些是

    方法描述
    matrix.T返回矩阵的转置。
    matrix.H返回self的(复数)共轭转置。
    matrix.I返回可逆self的(乘法)逆。
    matrix.A将self作为ndarray对象返回。

警告

Matrix对象覆盖乘法 ‘*’ 和 ‘**’(幂),分别为矩阵乘法和矩阵幂。 如果您的子例程可以接受子类,并且您没有转换为基类数组, 则必须使用ufuncs multiply和power来确保对所有输入执行正确的操作。

Matrix类是ndarray的Python子类,可以用作如何构造自己的ndarray子类的参考。 矩阵可以从其他矩阵、字符串和任何可以转换为 ndarray 的东西中创建。名称 “mat” 是NumPy中 “matrix” 的别名。

方法描述
matrixopen in new window(data[, dtype, copy])注意: 不建议再使用这个类,即使是线性的
asmatrixopen in new window(data[, dtype])将输入解析为矩阵。
bmatopen in new window(obj[, ldict, gdict])从字符串、嵌套序列或数组构建矩阵对象。

示例1:从字符串创建矩阵

>>> a=mat('1 2 3; 4 5 3')
>>> print (a*a.T).I
[[ 0.2924 -0.1345]
 [-0.1345  0.0819]]

示例2:从嵌套序列创建矩阵

>>> mat([[1,5,10],[1.0,3,4j]])
matrix([[  1.+0.j,   5.+0.j,  10.+0.j],
        [  1.+0.j,   3.+0.j,   0.+4.j]])

示例 3: 从数组创建矩阵

>>> mat(random.rand(3,3)).T
matrix([[ 0.7699,  0.7922,  0.3294],
        [ 0.2792,  0.0101,  0.9219],
        [ 0.3398,  0.7571,  0.8197]])

内存映射文件数组

内存映射文件对于读取和/或修改具有规则布局的大文件的小段非常有用, 而无需将整个文件读入内存。 ndarray的一个简单子类使用内存映射文件作为数组的数据缓冲区。 对于小文件,将整个文件读入内存的开销通常不大,但是对于大文件,使用内存映射可以节省大量资源。

内存映射文件数组还有一个额外的方法(除了它们从ndarray继承的方法之外):.flush()open in new window, 用户必须手动调用该方法,以确保对数组的任何更改都实际写入磁盘。

方法描述
memmapopen in new window创建存储在磁盘上二进制文件中的数组的内存映射。
memmap.flushopen in new window(self)将数组中的任何更改写入磁盘上的文件。

示例:

>>> a = memmap('newfile.dat', dtype=float, mode='w+', shape=1000)
>>> a[10] = 10.0
>>> a[30] = 30.0
>>> del a
>>> b = fromfile('newfile.dat', dtype=float)
>>> print b[10], b[30]
10.0 30.0
>>> a = memmap('newfile.dat', dtype=float)
>>> print a[10], a[30]
10.0 30.0

字符数组(numpy.char

另见

创建字符数组(numpy.char)

注意

chararrayopen in new window 类的存在是为了与Numarray向后兼容, 不建议在新开发中使用它。从 numpy 1.4 开始, 如果需要字符串数组,建议使用dtypeopen in new window object_string_unicode_ 的数组, 并使用 numpy.char 模块中的自由函数进行快速矢量化字符串操作。

这些是 string_ 类型或 unicode_ 类型的增强型数组。 这些数组继承自 ndarrayopen in new window ,但在(逐个)元素的基础上特别定义了操作 +, *, 和 % 。 这些操作在字符类型的标准 ndarrayopen in new window 上不可用。 此外,chararrayopen in new window 具有所有标准 stringopen in new window(和unicode )方法,在逐个元素的基础上执行它们。 也许创建chararray的最简单方法是使用 self.view(chararray)open in new window, 其中 self 是str或unicode数据类型的ndarray。 但是,也可以使用 numpy.chararrayopen in new window 构造函数或通过 numpy.char.arrayopen in new window 函数创建chararray:

方法描述
chararrayopen in new window(shape[, itemsize, unicode, …])提供有关字符串和unicode值数组的便捷视图。
core.defchararray.arrayopen in new window(obj[, itemsize, …])创建一个chararray。

与 str 数据类型的标准 ndarray 的另一个不同之处是 chararray 继承了由 Numarray 引入的特性, 即在项检索和比较操作中,数组中任何元素末尾的空格都将被忽略。

记录数组(numpy.rec

另见

Creating record arrays (numpy.rec)Data type routinesData type objects (dtype)

NumPy提供了 recarrayopen in new window 类,允许将结构化数组的字段作为属性进行访问, 以及相应的标量数据类型对象 记录open in new window

方法描述
recarrayopen in new window构造一个允许使用属性进行字段访问的ndarray。
recordopen in new window一种数据类型标量,允许字段访问作为属性查找。

掩码数组(numpy.ma

另见

Masked arrays

标准容器类

为了向后兼容并作为标准的“容器”类, Numeric的UserArray已被引入NumPy并命名为 numpy.lib.user_array.containeropen in new window 容器类是一个Python类, 其self.array属性是一个ndarray。 使用numpy.lib.user_array.container比使用ndarray本身更容易进行多重继承,因此默认包含它。 除了提及它的存在之外,这里没有记录,因为如果可以的话,我们鼓励你直接使用ndarray类。

方法描述
numpy.lib.user_array.containeropen in new window(data[, …])标准容器类,便于多重继承。

数组迭代器

迭代器是数组处理的强大概念。本质上,迭代器实现了一个通用的for循环。 如果 myiter 是一个迭代器对象,那么Python代码:

for val in myiter:
    ...
    some code involving val
    ...

重复调用 val = next(myiter),直到迭代器引发 StopIterationopen in new window。 有几种方法可以迭代可能有用的数组:默认迭代,平面迭代和-dimensional枚举。

默认迭代

ndarray对象的默认迭代器是序列类型的默认Python迭代器。 因此,当数组对象本身用作迭代器时。默认行为相当于:

for i in range(arr.shape[0]):
    val = arr[i]

此默认迭代器从数组中选择维度的子数组。 这可以是用于定义递归算法的有用构造。 要遍历整个数组,需要for循环。

>>> a = arange(24).reshape(3,2,4)+10
>>> for val in a:
...     print 'item:', val
item: [[10 11 12 13]
 [14 15 16 17]]
item: [[18 19 20 21]
 [22 23 24 25]]
item: [[26 27 28 29]
 [30 31 32 33]]

Flat 迭代

方法描述
ndarray.flatopen in new window数组上的一维迭代器。

如前所述,ndarray 对象的 flat 属性返回一个迭代器,它将以C风格的连续顺序循环遍历整个数组。

>>> for i, val in enumerate(a.flat):
...     if i%5 == 0: print i, val
0 10
5 15
10 20
15 25
20 30

在这里,我使用了内置的枚举迭代器来返回迭代器索引和值。

N维枚举

方法描述
ndenumerateopen in new window(arr)多维索引迭代器。

有时在迭代时获取N维索引可能是有用的。ndenumerate迭代器可以实现这一点。

>>> for i, val in ndenumerate(a):
...     if sum(i)%5 == 0: print i, val
(0, 0, 0) 10
(1, 1, 3) 25
(2, 0, 3) 29
(2, 1, 2) 32

广播迭代器

方法描述
broadcastopen in new window创建一个模仿广播的对象。

广播的一般概念也可以使用 broadcastopen in new window 迭代器从Python获得。 此对象将对象作为输入,并返回一个迭代器,该迭代器返回元组,提供广播结果中的每个输入序列元素。

>>> for val in broadcast([[1,0],[2,3]],[0,1]):
...     print val
(1, 0)
(0, 1)
(2, 0)
(3, 1)

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